Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMR0

Ankrd27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd27Q3UMR0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ankrd27Q3UMR0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ankrd27Q3UMR0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ankrd27Q3UMR0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ankrd27Q3UMR0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ankrd27Q3UMR0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ankrd27Q3UMR0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ankrd27Q3UMR0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ankrd27Q3UMR0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ankrd27Q3UMR0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ankrd27Q3UMR0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ankrd27Q3UMR0 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ankrd27Q3UMR0 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ankrd27Q3UMR0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ankrd27Q3UMR0 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ankrd27Q3UMR0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ankrd27Q3UMR0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ankrd27Q3UMR0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ankrd27Q3UMR0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ankrd27Q3UMR0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ankrd27Q3UMR0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ankrd27Q3UMR0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ankrd27Q3UMR0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ankrd27Q3UMR0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ankrd27Q3UMR0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ankrd27Q3UMR0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ankrd27Q3UMR0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ankrd27Q3UMR0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ankrd27Q3UMR0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ankrd27Q3UMR0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ankrd27Q3UMR0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ankrd27Q3UMR0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ankrd27Q3UMR0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ankrd27Q3UMR0 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ankrd27Q3UMR0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ankrd27Q3UMR0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ankrd27Q3UMR0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ankrd27Q3UMR0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ankrd27Q3UMR0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ankrd27Q3UMR0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ankrd27Q3UMR0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ankrd27Q3UMR0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ankrd27Q3UMR0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ankrd27Q3UMR0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ankrd27Q3UMR0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ankrd27Q3UMR0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ankrd27Q3UMR0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ankrd27Q3UMR0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ankrd27Q3UMR0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ankrd27Q3UMR0 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ankrd27Q3UMR0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ankrd27Q3UMR0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ankrd27Q3UMR0 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ankrd27Q3UMR0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ankrd27Q3UMR0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ankrd27Q3UMR0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ankrd27Q3UMR0 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ankrd27Q3UMR0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ankrd27Q3UMR0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ankrd27Q3UMR0 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ankrd27Q3UMR0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ankrd27Q3UMR0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ankrd27Q3UMR0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ankrd27Q3UMR0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ankrd27Q3UMR0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ankrd27Q3UMR0 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ankrd27Q3UMR0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ankrd27Q3UMR0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ankrd27Q3UMR0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ankrd27Q3UMR0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ankrd27Q3UMR0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ankrd27Q3UMR0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ankrd27Q3UMR0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ankrd27Q3UMR0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ankrd27Q3UMR0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ankrd27Q3UMR0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ankrd27Q3UMR0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ankrd27Q3UMR0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ankrd27Q3UMR0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ankrd27Q3UMR0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ankrd27Q3UMR0 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ankrd27Q3UMR0 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ankrd27Q3UMR0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ankrd27Q3UMR0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ankrd27Q3UMR0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ankrd27Q3UMR0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ankrd27Q3UMR0 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ankrd27Q3UMR0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ankrd27Q3UMR0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ankrd27Q3UMR0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ankrd27Q3UMR0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ankrd27Q3UMR0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ankrd27Q3UMR0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ankrd27Q3UMR0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ankrd27Q3UMR0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ankrd27Q3UMR0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ankrd27Q3UMR0 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ankrd27Q3UMR0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ankrd27Q3UMR0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ankrd27Q3UMR0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms