Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMF0

Cobll1, Cordon-bleu protein-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cobll1Q3UMF0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cobll1Q3UMF0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cobll1Q3UMF0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cobll1Q3UMF0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cobll1Q3UMF0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cobll1Q3UMF0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cobll1Q3UMF0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cobll1Q3UMF0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cobll1Q3UMF0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cobll1Q3UMF0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cobll1Q3UMF0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cobll1Q3UMF0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cobll1Q3UMF0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cobll1Q3UMF0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cobll1Q3UMF0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cobll1Q3UMF0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cobll1Q3UMF0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cobll1Q3UMF0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cobll1Q3UMF0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cobll1Q3UMF0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cobll1Q3UMF0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cobll1Q3UMF0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cobll1Q3UMF0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cobll1Q3UMF0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cobll1Q3UMF0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cobll1Q3UMF0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cobll1Q3UMF0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cobll1Q3UMF0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cobll1Q3UMF0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cobll1Q3UMF0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cobll1Q3UMF0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cobll1Q3UMF0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cobll1Q3UMF0 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cobll1Q3UMF0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cobll1Q3UMF0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cobll1Q3UMF0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cobll1Q3UMF0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cobll1Q3UMF0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cobll1Q3UMF0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cobll1Q3UMF0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cobll1Q3UMF0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cobll1Q3UMF0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cobll1Q3UMF0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cobll1Q3UMF0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cobll1Q3UMF0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cobll1Q3UMF0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cobll1Q3UMF0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cobll1Q3UMF0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cobll1Q3UMF0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cobll1Q3UMF0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cobll1Q3UMF0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cobll1Q3UMF0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cobll1Q3UMF0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cobll1Q3UMF0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cobll1Q3UMF0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cobll1Q3UMF0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cobll1Q3UMF0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cobll1Q3UMF0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cobll1Q3UMF0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cobll1Q3UMF0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cobll1Q3UMF0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cobll1Q3UMF0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cobll1Q3UMF0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cobll1Q3UMF0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cobll1Q3UMF0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cobll1Q3UMF0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cobll1Q3UMF0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cobll1Q3UMF0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cobll1Q3UMF0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cobll1Q3UMF0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cobll1Q3UMF0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cobll1Q3UMF0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cobll1Q3UMF0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cobll1Q3UMF0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cobll1Q3UMF0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cobll1Q3UMF0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cobll1Q3UMF0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cobll1Q3UMF0 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cobll1Q3UMF0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cobll1Q3UMF0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cobll1Q3UMF0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cobll1Q3UMF0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cobll1Q3UMF0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cobll1Q3UMF0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cobll1Q3UMF0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cobll1Q3UMF0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cobll1Q3UMF0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cobll1Q3UMF0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cobll1Q3UMF0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cobll1Q3UMF0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms