Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMB9

Washc4, WASH complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Washc4Q3UMB9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Washc4Q3UMB9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Washc4Q3UMB9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Washc4Q3UMB9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Washc4Q3UMB9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Washc4Q3UMB9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Washc4Q3UMB9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Washc4Q3UMB9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Washc4Q3UMB9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Washc4Q3UMB9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Washc4Q3UMB9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Washc4Q3UMB9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Washc4Q3UMB9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Washc4Q3UMB9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Washc4Q3UMB9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Washc4Q3UMB9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Washc4Q3UMB9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Washc4Q3UMB9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Washc4Q3UMB9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Washc4Q3UMB9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Washc4Q3UMB9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Washc4Q3UMB9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Washc4Q3UMB9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Washc4Q3UMB9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Washc4Q3UMB9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Washc4Q3UMB9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Washc4Q3UMB9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Washc4Q3UMB9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Washc4Q3UMB9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Washc4Q3UMB9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Washc4Q3UMB9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Washc4Q3UMB9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Washc4Q3UMB9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Washc4Q3UMB9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Washc4Q3UMB9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Washc4Q3UMB9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Washc4Q3UMB9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Washc4Q3UMB9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Washc4Q3UMB9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Washc4Q3UMB9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Washc4Q3UMB9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Washc4Q3UMB9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Washc4Q3UMB9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Washc4Q3UMB9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Washc4Q3UMB9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Washc4Q3UMB9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Washc4Q3UMB9 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Washc4Q3UMB9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Washc4Q3UMB9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Washc4Q3UMB9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Washc4Q3UMB9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Washc4Q3UMB9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Washc4Q3UMB9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Washc4Q3UMB9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Washc4Q3UMB9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Washc4Q3UMB9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Washc4Q3UMB9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Washc4Q3UMB9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Washc4Q3UMB9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Washc4Q3UMB9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Washc4Q3UMB9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Washc4Q3UMB9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Washc4Q3UMB9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Washc4Q3UMB9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Washc4Q3UMB9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Washc4Q3UMB9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Washc4Q3UMB9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Washc4Q3UMB9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Washc4Q3UMB9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Washc4Q3UMB9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Washc4Q3UMB9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Washc4Q3UMB9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Washc4Q3UMB9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Washc4Q3UMB9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Washc4Q3UMB9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Washc4Q3UMB9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Washc4Q3UMB9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Washc4Q3UMB9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Washc4Q3UMB9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Washc4Q3UMB9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Washc4Q3UMB9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Washc4Q3UMB9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Washc4Q3UMB9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Washc4Q3UMB9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Washc4Q3UMB9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Washc4Q3UMB9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Washc4Q3UMB9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Washc4Q3UMB9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Washc4Q3UMB9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Washc4Q3UMB9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Washc4Q3UMB9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Washc4Q3UMB9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Washc4Q3UMB9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Washc4Q3UMB9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Washc4Q3UMB9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Washc4Q3UMB9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Washc4Q3UMB9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Washc4Q3UMB9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Washc4Q3UMB9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Washc4Q3UMB9 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms