Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULF4

Spg7, Paraplegin, mousemouse

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spg7Q3ULF4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Spg7Q3ULF4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Spg7Q3ULF4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Spg7Q3ULF4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Spg7Q3ULF4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Spg7Q3ULF4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Spg7Q3ULF4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Spg7Q3ULF4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Spg7Q3ULF4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Spg7Q3ULF4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Spg7Q3ULF4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Spg7Q3ULF4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Spg7Q3ULF4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Spg7Q3ULF4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Spg7Q3ULF4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Spg7Q3ULF4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Spg7Q3ULF4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Spg7Q3ULF4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Spg7Q3ULF4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Spg7Q3ULF4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Spg7Q3ULF4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Spg7Q3ULF4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Spg7Q3ULF4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Spg7Q3ULF4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Spg7Q3ULF4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Spg7Q3ULF4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Spg7Q3ULF4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Spg7Q3ULF4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Spg7Q3ULF4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Spg7Q3ULF4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Spg7Q3ULF4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Spg7Q3ULF4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Spg7Q3ULF4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Spg7Q3ULF4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Spg7Q3ULF4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Spg7Q3ULF4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Spg7Q3ULF4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Spg7Q3ULF4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Spg7Q3ULF4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Spg7Q3ULF4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Spg7Q3ULF4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Spg7Q3ULF4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Spg7Q3ULF4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Spg7Q3ULF4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Spg7Q3ULF4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Spg7Q3ULF4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Spg7Q3ULF4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Spg7Q3ULF4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Spg7Q3ULF4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Spg7Q3ULF4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Spg7Q3ULF4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Spg7Q3ULF4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Spg7Q3ULF4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Spg7Q3ULF4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Spg7Q3ULF4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Spg7Q3ULF4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Spg7Q3ULF4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Spg7Q3ULF4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Spg7Q3ULF4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Spg7Q3ULF4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Spg7Q3ULF4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Spg7Q3ULF4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Spg7Q3ULF4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Spg7Q3ULF4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Spg7Q3ULF4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Spg7Q3ULF4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Spg7Q3ULF4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Spg7Q3ULF4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Spg7Q3ULF4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Spg7Q3ULF4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Spg7Q3ULF4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Spg7Q3ULF4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Spg7Q3ULF4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Spg7Q3ULF4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Spg7Q3ULF4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Spg7Q3ULF4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Spg7Q3ULF4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Spg7Q3ULF4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Spg7Q3ULF4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Spg7Q3ULF4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Spg7Q3ULF4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Spg7Q3ULF4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Spg7Q3ULF4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Spg7Q3ULF4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Spg7Q3ULF4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Spg7Q3ULF4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Spg7Q3ULF4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Spg7Q3ULF4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Spg7Q3ULF4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Spg7Q3ULF4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Spg7Q3ULF4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Spg7Q3ULF4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Spg7Q3ULF4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Spg7Q3ULF4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Spg7Q3ULF4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Spg7Q3ULF4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Spg7Q3ULF4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Spg7Q3ULF4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Spg7Q3ULF4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Spg7Q3ULF4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms