Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJK4

Gtpbp2, GTP-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp2Q3UJK4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gtpbp2Q3UJK4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gtpbp2Q3UJK4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gtpbp2Q3UJK4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtpbp2Q3UJK4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtpbp2Q3UJK4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtpbp2Q3UJK4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtpbp2Q3UJK4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtpbp2Q3UJK4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtpbp2Q3UJK4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtpbp2Q3UJK4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtpbp2Q3UJK4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtpbp2Q3UJK4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtpbp2Q3UJK4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtpbp2Q3UJK4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtpbp2Q3UJK4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtpbp2Q3UJK4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtpbp2Q3UJK4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtpbp2Q3UJK4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtpbp2Q3UJK4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtpbp2Q3UJK4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtpbp2Q3UJK4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gtpbp2Q3UJK4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gtpbp2Q3UJK4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gtpbp2Q3UJK4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gtpbp2Q3UJK4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gtpbp2Q3UJK4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gtpbp2Q3UJK4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gtpbp2Q3UJK4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gtpbp2Q3UJK4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gtpbp2Q3UJK4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gtpbp2Q3UJK4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gtpbp2Q3UJK4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gtpbp2Q3UJK4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gtpbp2Q3UJK4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gtpbp2Q3UJK4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gtpbp2Q3UJK4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Gtpbp2Q3UJK4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtpbp2Q3UJK4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtpbp2Q3UJK4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtpbp2Q3UJK4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtpbp2Q3UJK4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtpbp2Q3UJK4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtpbp2Q3UJK4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtpbp2Q3UJK4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtpbp2Q3UJK4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtpbp2Q3UJK4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtpbp2Q3UJK4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtpbp2Q3UJK4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtpbp2Q3UJK4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtpbp2Q3UJK4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtpbp2Q3UJK4 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gtpbp2Q3UJK4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gtpbp2Q3UJK4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gtpbp2Q3UJK4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gtpbp2Q3UJK4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gtpbp2Q3UJK4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtpbp2Q3UJK4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtpbp2Q3UJK4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtpbp2Q3UJK4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtpbp2Q3UJK4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtpbp2Q3UJK4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtpbp2Q3UJK4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtpbp2Q3UJK4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtpbp2Q3UJK4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtpbp2Q3UJK4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtpbp2Q3UJK4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtpbp2Q3UJK4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtpbp2Q3UJK4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtpbp2Q3UJK4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtpbp2Q3UJK4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtpbp2Q3UJK4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtpbp2Q3UJK4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtpbp2Q3UJK4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtpbp2Q3UJK4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtpbp2Q3UJK4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtpbp2Q3UJK4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtpbp2Q3UJK4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtpbp2Q3UJK4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtpbp2Q3UJK4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtpbp2Q3UJK4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtpbp2Q3UJK4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtpbp2Q3UJK4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtpbp2Q3UJK4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtpbp2Q3UJK4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtpbp2Q3UJK4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtpbp2Q3UJK4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtpbp2Q3UJK4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtpbp2Q3UJK4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtpbp2Q3UJK4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtpbp2Q3UJK4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtpbp2Q3UJK4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtpbp2Q3UJK4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtpbp2Q3UJK4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtpbp2Q3UJK4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtpbp2Q3UJK4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtpbp2Q3UJK4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtpbp2Q3UJK4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtpbp2Q3UJK4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtpbp2Q3UJK4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms