Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJF0

Gpr55, G-protein coupled receptor 55, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr55Q3UJF0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpr55Q3UJF0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpr55Q3UJF0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpr55Q3UJF0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpr55Q3UJF0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpr55Q3UJF0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpr55Q3UJF0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpr55Q3UJF0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpr55Q3UJF0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpr55Q3UJF0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpr55Q3UJF0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpr55Q3UJF0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpr55Q3UJF0 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpr55Q3UJF0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpr55Q3UJF0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpr55Q3UJF0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpr55Q3UJF0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpr55Q3UJF0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpr55Q3UJF0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpr55Q3UJF0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpr55Q3UJF0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpr55Q3UJF0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpr55Q3UJF0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpr55Q3UJF0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpr55Q3UJF0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpr55Q3UJF0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpr55Q3UJF0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpr55Q3UJF0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpr55Q3UJF0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpr55Q3UJF0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpr55Q3UJF0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpr55Q3UJF0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpr55Q3UJF0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpr55Q3UJF0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpr55Q3UJF0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpr55Q3UJF0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpr55Q3UJF0 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpr55Q3UJF0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpr55Q3UJF0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gpr55Q3UJF0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gpr55Q3UJF0 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gpr55Q3UJF0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gpr55Q3UJF0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gpr55Q3UJF0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpr55Q3UJF0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpr55Q3UJF0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpr55Q3UJF0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpr55Q3UJF0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpr55Q3UJF0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpr55Q3UJF0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpr55Q3UJF0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpr55Q3UJF0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpr55Q3UJF0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpr55Q3UJF0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpr55Q3UJF0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpr55Q3UJF0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpr55Q3UJF0 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpr55Q3UJF0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpr55Q3UJF0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpr55Q3UJF0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpr55Q3UJF0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpr55Q3UJF0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpr55Q3UJF0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpr55Q3UJF0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpr55Q3UJF0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpr55Q3UJF0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpr55Q3UJF0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpr55Q3UJF0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpr55Q3UJF0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpr55Q3UJF0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpr55Q3UJF0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpr55Q3UJF0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpr55Q3UJF0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpr55Q3UJF0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpr55Q3UJF0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpr55Q3UJF0 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpr55Q3UJF0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpr55Q3UJF0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpr55Q3UJF0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpr55Q3UJF0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpr55Q3UJF0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpr55Q3UJF0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpr55Q3UJF0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpr55Q3UJF0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpr55Q3UJF0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpr55Q3UJF0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpr55Q3UJF0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpr55Q3UJF0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpr55Q3UJF0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpr55Q3UJF0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpr55Q3UJF0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpr55Q3UJF0 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpr55Q3UJF0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpr55Q3UJF0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpr55Q3UJF0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpr55Q3UJF0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpr55Q3UJF0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpr55Q3UJF0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpr55Q3UJF0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpr55Q3UJF0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms