Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp19Q3UJD6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp19Q3UJD6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp19Q3UJD6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp19Q3UJD6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp19Q3UJD6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp19Q3UJD6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp19Q3UJD6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp19Q3UJD6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp19Q3UJD6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp19Q3UJD6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp19Q3UJD6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp19Q3UJD6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp19Q3UJD6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp19Q3UJD6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp19Q3UJD6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp19Q3UJD6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp19Q3UJD6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp19Q3UJD6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp19Q3UJD6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp19Q3UJD6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp19Q3UJD6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp19Q3UJD6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp19Q3UJD6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp19Q3UJD6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp19Q3UJD6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp19Q3UJD6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp19Q3UJD6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp19Q3UJD6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp19Q3UJD6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp19Q3UJD6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp19Q3UJD6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp19Q3UJD6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp19Q3UJD6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp19Q3UJD6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp19Q3UJD6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp19Q3UJD6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp19Q3UJD6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp19Q3UJD6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp19Q3UJD6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp19Q3UJD6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp19Q3UJD6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp19Q3UJD6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp19Q3UJD6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp19Q3UJD6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp19Q3UJD6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp19Q3UJD6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp19Q3UJD6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp19Q3UJD6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp19Q3UJD6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp19Q3UJD6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp19Q3UJD6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp19Q3UJD6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp19Q3UJD6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Usp19Q3UJD6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp19Q3UJD6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp19Q3UJD6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp19Q3UJD6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp19Q3UJD6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp19Q3UJD6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp19Q3UJD6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp19Q3UJD6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp19Q3UJD6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp19Q3UJD6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp19Q3UJD6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp19Q3UJD6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp19Q3UJD6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp19Q3UJD6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp19Q3UJD6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp19Q3UJD6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp19Q3UJD6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp19Q3UJD6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp19Q3UJD6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp19Q3UJD6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp19Q3UJD6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp19Q3UJD6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp19Q3UJD6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp19Q3UJD6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp19Q3UJD6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp19Q3UJD6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp19Q3UJD6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp19Q3UJD6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp19Q3UJD6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp19Q3UJD6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp19Q3UJD6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp19Q3UJD6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp19Q3UJD6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp19Q3UJD6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp19Q3UJD6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp19Q3UJD6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp19Q3UJD6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp19Q3UJD6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp19Q3UJD6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp19Q3UJD6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp19Q3UJD6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp19Q3UJD6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp19Q3UJD6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp19Q3UJD6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp19Q3UJD6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp19Q3UJD6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.4 ms