Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHK3

Greb1, Protein GREB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,954 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Greb1Q3UHK3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Greb1Q3UHK3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Greb1Q3UHK3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Greb1Q3UHK3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Greb1Q3UHK3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Greb1Q3UHK3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Greb1Q3UHK3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Greb1Q3UHK3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Greb1Q3UHK3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Greb1Q3UHK3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Greb1Q3UHK3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Greb1Q3UHK3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Greb1Q3UHK3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Greb1Q3UHK3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Greb1Q3UHK3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Greb1Q3UHK3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Greb1Q3UHK3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Greb1Q3UHK3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Greb1Q3UHK3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Greb1Q3UHK3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Greb1Q3UHK3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Greb1Q3UHK3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Greb1Q3UHK3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Greb1Q3UHK3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Greb1Q3UHK3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Greb1Q3UHK3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Greb1Q3UHK3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Greb1Q3UHK3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Greb1Q3UHK3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Greb1Q3UHK3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Greb1Q3UHK3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Greb1Q3UHK3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Greb1Q3UHK3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Greb1Q3UHK3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Greb1Q3UHK3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Greb1Q3UHK3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Greb1Q3UHK3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Greb1Q3UHK3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Greb1Q3UHK3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Greb1Q3UHK3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Greb1Q3UHK3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Greb1Q3UHK3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Greb1Q3UHK3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Greb1Q3UHK3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Greb1Q3UHK3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Greb1Q3UHK3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Greb1Q3UHK3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Greb1Q3UHK3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Greb1Q3UHK3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Greb1Q3UHK3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Greb1Q3UHK3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Greb1Q3UHK3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Greb1Q3UHK3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Greb1Q3UHK3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Greb1Q3UHK3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Greb1Q3UHK3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Greb1Q3UHK3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Greb1Q3UHK3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Greb1Q3UHK3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Greb1Q3UHK3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Greb1Q3UHK3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Greb1Q3UHK3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Greb1Q3UHK3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Greb1Q3UHK3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Greb1Q3UHK3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Greb1Q3UHK3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Greb1Q3UHK3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Greb1Q3UHK3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Greb1Q3UHK3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Greb1Q3UHK3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Greb1Q3UHK3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Greb1Q3UHK3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Greb1Q3UHK3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Greb1Q3UHK3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Greb1Q3UHK3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Greb1Q3UHK3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Greb1Q3UHK3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Greb1Q3UHK3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Greb1Q3UHK3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Greb1Q3UHK3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Greb1Q3UHK3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Greb1Q3UHK3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Greb1Q3UHK3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Greb1Q3UHK3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Greb1Q3UHK3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Greb1Q3UHK3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Greb1Q3UHK3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Greb1Q3UHK3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Greb1Q3UHK3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Greb1Q3UHK3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Greb1Q3UHK3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Greb1Q3UHK3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Greb1Q3UHK3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Greb1Q3UHK3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Greb1Q3UHK3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Greb1Q3UHK3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Greb1Q3UHK3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Greb1Q3UHK3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Greb1Q3UHK3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Greb1Q3UHK3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms