Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHH1

Zswim8, Zinc finger SWIM domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zswim8Q3UHH1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Zswim8Q3UHH1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zswim8Q3UHH1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zswim8Q3UHH1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zswim8Q3UHH1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Zswim8Q3UHH1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zswim8Q3UHH1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zswim8Q3UHH1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Zswim8Q3UHH1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zswim8Q3UHH1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zswim8Q3UHH1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zswim8Q3UHH1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zswim8Q3UHH1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Zswim8Q3UHH1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zswim8Q3UHH1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Zswim8Q3UHH1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zswim8Q3UHH1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zswim8Q3UHH1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zswim8Q3UHH1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zswim8Q3UHH1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zswim8Q3UHH1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zswim8Q3UHH1 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zswim8Q3UHH1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zswim8Q3UHH1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zswim8Q3UHH1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Zswim8Q3UHH1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zswim8Q3UHH1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Zswim8Q3UHH1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Zswim8Q3UHH1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zswim8Q3UHH1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zswim8Q3UHH1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zswim8Q3UHH1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zswim8Q3UHH1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zswim8Q3UHH1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Zswim8Q3UHH1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Zswim8Q3UHH1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zswim8Q3UHH1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zswim8Q3UHH1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zswim8Q3UHH1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zswim8Q3UHH1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zswim8Q3UHH1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zswim8Q3UHH1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Zswim8Q3UHH1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Zswim8Q3UHH1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zswim8Q3UHH1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zswim8Q3UHH1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Zswim8Q3UHH1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zswim8Q3UHH1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zswim8Q3UHH1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zswim8Q3UHH1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zswim8Q3UHH1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zswim8Q3UHH1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zswim8Q3UHH1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zswim8Q3UHH1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zswim8Q3UHH1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zswim8Q3UHH1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zswim8Q3UHH1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zswim8Q3UHH1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zswim8Q3UHH1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zswim8Q3UHH1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zswim8Q3UHH1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zswim8Q3UHH1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zswim8Q3UHH1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zswim8Q3UHH1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zswim8Q3UHH1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zswim8Q3UHH1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zswim8Q3UHH1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zswim8Q3UHH1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zswim8Q3UHH1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zswim8Q3UHH1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zswim8Q3UHH1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zswim8Q3UHH1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zswim8Q3UHH1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zswim8Q3UHH1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zswim8Q3UHH1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zswim8Q3UHH1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zswim8Q3UHH1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zswim8Q3UHH1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zswim8Q3UHH1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zswim8Q3UHH1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zswim8Q3UHH1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zswim8Q3UHH1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zswim8Q3UHH1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zswim8Q3UHH1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zswim8Q3UHH1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zswim8Q3UHH1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zswim8Q3UHH1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zswim8Q3UHH1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Zswim8Q3UHH1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Zswim8Q3UHH1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zswim8Q3UHH1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zswim8Q3UHH1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zswim8Q3UHH1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zswim8Q3UHH1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zswim8Q3UHH1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zswim8Q3UHH1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Zswim8Q3UHH1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zswim8Q3UHH1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zswim8Q3UHH1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zswim8Q3UHH1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms