Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFM5

Nom1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 854 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nom1Q3UFM5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nom1Q3UFM5 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nom1Q3UFM5 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Nom1Q3UFM5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nom1Q3UFM5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nom1Q3UFM5 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nom1Q3UFM5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nom1Q3UFM5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nom1Q3UFM5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nom1Q3UFM5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nom1Q3UFM5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nom1Q3UFM5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nom1Q3UFM5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nom1Q3UFM5 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nom1Q3UFM5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nom1Q3UFM5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nom1Q3UFM5 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nom1Q3UFM5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Nom1Q3UFM5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nom1Q3UFM5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nom1Q3UFM5 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nom1Q3UFM5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nom1Q3UFM5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nom1Q3UFM5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Nom1Q3UFM5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Nom1Q3UFM5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nom1Q3UFM5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nom1Q3UFM5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nom1Q3UFM5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nom1Q3UFM5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nom1Q3UFM5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nom1Q3UFM5 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nom1Q3UFM5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nom1Q3UFM5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nom1Q3UFM5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nom1Q3UFM5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nom1Q3UFM5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nom1Q3UFM5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nom1Q3UFM5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nom1Q3UFM5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nom1Q3UFM5 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nom1Q3UFM5 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nom1Q3UFM5 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nom1Q3UFM5 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nom1Q3UFM5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nom1Q3UFM5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nom1Q3UFM5 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nom1Q3UFM5 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nom1Q3UFM5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nom1Q3UFM5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nom1Q3UFM5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nom1Q3UFM5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nom1Q3UFM5 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nom1Q3UFM5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nom1Q3UFM5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nom1Q3UFM5 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nom1Q3UFM5 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nom1Q3UFM5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nom1Q3UFM5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nom1Q3UFM5 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nom1Q3UFM5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nom1Q3UFM5 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Nom1Q3UFM5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nom1Q3UFM5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nom1Q3UFM5 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nom1Q3UFM5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nom1Q3UFM5 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nom1Q3UFM5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nom1Q3UFM5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nom1Q3UFM5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nom1Q3UFM5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nom1Q3UFM5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nom1Q3UFM5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nom1Q3UFM5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nom1Q3UFM5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nom1Q3UFM5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nom1Q3UFM5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nom1Q3UFM5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nom1Q3UFM5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nom1Q3UFM5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nom1Q3UFM5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nom1Q3UFM5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nom1Q3UFM5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nom1Q3UFM5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Nom1Q3UFM5 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nom1Q3UFM5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nom1Q3UFM5 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nom1Q3UFM5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nom1Q3UFM5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nom1Q3UFM5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nom1Q3UFM5 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nom1Q3UFM5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nom1Q3UFM5 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nom1Q3UFM5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nom1Q3UFM5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nom1Q3UFM5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nom1Q3UFM5 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nom1Q3UFM5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nom1Q3UFM5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nom1Q3UFM5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms