Protein–RNA interactions for Protein: Q3UF64

Rnft2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft2Q3UF64 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rnft2Q3UF64 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rnft2Q3UF64 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnft2Q3UF64 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnft2Q3UF64 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnft2Q3UF64 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnft2Q3UF64 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms