Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEZ8

Slc10a4, Sodium/bile acid cotransporter 4, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc10a4Q3UEZ8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc10a4Q3UEZ8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc10a4Q3UEZ8 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc10a4Q3UEZ8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc10a4Q3UEZ8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc10a4Q3UEZ8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc10a4Q3UEZ8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc10a4Q3UEZ8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc10a4Q3UEZ8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc10a4Q3UEZ8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc10a4Q3UEZ8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc10a4Q3UEZ8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc10a4Q3UEZ8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc10a4Q3UEZ8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc10a4Q3UEZ8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc10a4Q3UEZ8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc10a4Q3UEZ8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc10a4Q3UEZ8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc10a4Q3UEZ8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc10a4Q3UEZ8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc10a4Q3UEZ8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc10a4Q3UEZ8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc10a4Q3UEZ8 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc10a4Q3UEZ8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc10a4Q3UEZ8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc10a4Q3UEZ8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc10a4Q3UEZ8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc10a4Q3UEZ8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc10a4Q3UEZ8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc10a4Q3UEZ8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc10a4Q3UEZ8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc10a4Q3UEZ8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc10a4Q3UEZ8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc10a4Q3UEZ8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc10a4Q3UEZ8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc10a4Q3UEZ8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc10a4Q3UEZ8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc10a4Q3UEZ8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc10a4Q3UEZ8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc10a4Q3UEZ8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc10a4Q3UEZ8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc10a4Q3UEZ8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc10a4Q3UEZ8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc10a4Q3UEZ8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc10a4Q3UEZ8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc10a4Q3UEZ8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc10a4Q3UEZ8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc10a4Q3UEZ8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc10a4Q3UEZ8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc10a4Q3UEZ8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc10a4Q3UEZ8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc10a4Q3UEZ8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc10a4Q3UEZ8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc10a4Q3UEZ8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc10a4Q3UEZ8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc10a4Q3UEZ8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc10a4Q3UEZ8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc10a4Q3UEZ8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc10a4Q3UEZ8 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc10a4Q3UEZ8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc10a4Q3UEZ8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc10a4Q3UEZ8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc10a4Q3UEZ8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc10a4Q3UEZ8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc10a4Q3UEZ8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc10a4Q3UEZ8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc10a4Q3UEZ8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc10a4Q3UEZ8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc10a4Q3UEZ8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc10a4Q3UEZ8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc10a4Q3UEZ8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc10a4Q3UEZ8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc10a4Q3UEZ8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc10a4Q3UEZ8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc10a4Q3UEZ8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc10a4Q3UEZ8 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc10a4Q3UEZ8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc10a4Q3UEZ8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc10a4Q3UEZ8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc10a4Q3UEZ8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc10a4Q3UEZ8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc10a4Q3UEZ8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc10a4Q3UEZ8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc10a4Q3UEZ8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc10a4Q3UEZ8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc10a4Q3UEZ8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc10a4Q3UEZ8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc10a4Q3UEZ8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc10a4Q3UEZ8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc10a4Q3UEZ8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc10a4Q3UEZ8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc10a4Q3UEZ8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc10a4Q3UEZ8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc10a4Q3UEZ8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc10a4Q3UEZ8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc10a4Q3UEZ8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc10a4Q3UEZ8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc10a4Q3UEZ8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc10a4Q3UEZ8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc10a4Q3UEZ8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms