Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Puf60Q3UEB3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Puf60Q3UEB3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Puf60Q3UEB3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Puf60Q3UEB3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Puf60Q3UEB3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Puf60Q3UEB3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Puf60Q3UEB3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Puf60Q3UEB3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Puf60Q3UEB3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Puf60Q3UEB3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Puf60Q3UEB3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Puf60Q3UEB3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Puf60Q3UEB3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Puf60Q3UEB3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Puf60Q3UEB3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Puf60Q3UEB3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Puf60Q3UEB3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Puf60Q3UEB3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Puf60Q3UEB3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Puf60Q3UEB3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Puf60Q3UEB3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Puf60Q3UEB3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Puf60Q3UEB3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Puf60Q3UEB3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Puf60Q3UEB3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Puf60Q3UEB3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Puf60Q3UEB3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Puf60Q3UEB3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Puf60Q3UEB3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Puf60Q3UEB3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Puf60Q3UEB3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Puf60Q3UEB3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Puf60Q3UEB3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Puf60Q3UEB3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Puf60Q3UEB3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Puf60Q3UEB3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Puf60Q3UEB3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Puf60Q3UEB3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Puf60Q3UEB3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Puf60Q3UEB3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Puf60Q3UEB3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Puf60Q3UEB3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Puf60Q3UEB3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Puf60Q3UEB3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Puf60Q3UEB3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Puf60Q3UEB3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Puf60Q3UEB3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Puf60Q3UEB3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Puf60Q3UEB3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Puf60Q3UEB3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Puf60Q3UEB3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Puf60Q3UEB3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Puf60Q3UEB3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Puf60Q3UEB3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Puf60Q3UEB3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Puf60Q3UEB3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Puf60Q3UEB3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Puf60Q3UEB3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Puf60Q3UEB3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Puf60Q3UEB3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Puf60Q3UEB3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Puf60Q3UEB3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Puf60Q3UEB3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Puf60Q3UEB3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Puf60Q3UEB3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Puf60Q3UEB3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Puf60Q3UEB3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Puf60Q3UEB3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Puf60Q3UEB3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Puf60Q3UEB3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Puf60Q3UEB3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Puf60Q3UEB3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Puf60Q3UEB3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Puf60Q3UEB3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Puf60Q3UEB3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Puf60Q3UEB3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Puf60Q3UEB3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Puf60Q3UEB3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Puf60Q3UEB3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Puf60Q3UEB3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Puf60Q3UEB3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Puf60Q3UEB3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Puf60Q3UEB3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Puf60Q3UEB3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Puf60Q3UEB3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Puf60Q3UEB3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Puf60Q3UEB3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Puf60Q3UEB3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Puf60Q3UEB3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Puf60Q3UEB3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Puf60Q3UEB3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Puf60Q3UEB3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Puf60Q3UEB3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Puf60Q3UEB3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Puf60Q3UEB3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Puf60Q3UEB3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Puf60Q3UEB3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Puf60Q3UEB3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Puf60Q3UEB3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms