Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9F6

Rnf166, RING finger protein 166, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf166Q3U9F6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf166Q3U9F6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf166Q3U9F6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf166Q3U9F6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf166Q3U9F6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf166Q3U9F6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf166Q3U9F6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf166Q3U9F6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf166Q3U9F6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf166Q3U9F6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf166Q3U9F6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf166Q3U9F6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf166Q3U9F6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf166Q3U9F6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf166Q3U9F6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf166Q3U9F6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf166Q3U9F6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf166Q3U9F6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf166Q3U9F6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf166Q3U9F6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf166Q3U9F6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf166Q3U9F6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf166Q3U9F6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf166Q3U9F6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf166Q3U9F6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf166Q3U9F6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf166Q3U9F6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf166Q3U9F6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf166Q3U9F6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf166Q3U9F6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf166Q3U9F6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf166Q3U9F6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf166Q3U9F6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf166Q3U9F6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf166Q3U9F6 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf166Q3U9F6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf166Q3U9F6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf166Q3U9F6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf166Q3U9F6 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf166Q3U9F6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf166Q3U9F6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf166Q3U9F6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf166Q3U9F6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf166Q3U9F6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf166Q3U9F6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf166Q3U9F6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf166Q3U9F6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf166Q3U9F6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf166Q3U9F6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf166Q3U9F6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf166Q3U9F6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf166Q3U9F6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf166Q3U9F6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf166Q3U9F6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf166Q3U9F6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf166Q3U9F6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rnf166Q3U9F6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rnf166Q3U9F6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rnf166Q3U9F6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rnf166Q3U9F6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rnf166Q3U9F6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rnf166Q3U9F6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rnf166Q3U9F6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rnf166Q3U9F6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rnf166Q3U9F6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf166Q3U9F6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf166Q3U9F6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf166Q3U9F6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf166Q3U9F6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf166Q3U9F6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf166Q3U9F6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf166Q3U9F6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf166Q3U9F6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf166Q3U9F6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf166Q3U9F6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf166Q3U9F6 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf166Q3U9F6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf166Q3U9F6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf166Q3U9F6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf166Q3U9F6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf166Q3U9F6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf166Q3U9F6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf166Q3U9F6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf166Q3U9F6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf166Q3U9F6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf166Q3U9F6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf166Q3U9F6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf166Q3U9F6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf166Q3U9F6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf166Q3U9F6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf166Q3U9F6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf166Q3U9F6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf166Q3U9F6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf166Q3U9F6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf166Q3U9F6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf166Q3U9F6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf166Q3U9F6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf166Q3U9F6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf166Q3U9F6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf166Q3U9F6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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