Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnf180Q3U827 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnf180Q3U827 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnf180Q3U827 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnf180Q3U827 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnf180Q3U827 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnf180Q3U827 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rnf180Q3U827 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rnf180Q3U827 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Rnf180Q3U827 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rnf180Q3U827 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rnf180Q3U827 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Rnf180Q3U827 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rnf180Q3U827 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf180Q3U827 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf180Q3U827 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf180Q3U827 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf180Q3U827 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf180Q3U827 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf180Q3U827 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf180Q3U827 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf180Q3U827 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf180Q3U827 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf180Q3U827 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnf180Q3U827 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnf180Q3U827 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnf180Q3U827 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnf180Q3U827 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnf180Q3U827 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnf180Q3U827 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnf180Q3U827 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnf180Q3U827 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnf180Q3U827 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnf180Q3U827 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnf180Q3U827 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnf180Q3U827 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnf180Q3U827 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnf180Q3U827 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnf180Q3U827 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnf180Q3U827 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnf180Q3U827 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnf180Q3U827 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnf180Q3U827 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf180Q3U827 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf180Q3U827 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf180Q3U827 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf180Q3U827 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf180Q3U827 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf180Q3U827 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf180Q3U827 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf180Q3U827 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf180Q3U827 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Rnf180Q3U827 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rnf180Q3U827 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Rnf180Q3U827 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rnf180Q3U827 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rnf180Q3U827 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rnf180Q3U827 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rnf180Q3U827 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rnf180Q3U827 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnf180Q3U827 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnf180Q3U827 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnf180Q3U827 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnf180Q3U827 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnf180Q3U827 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
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Rnf180Q3U827 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf180Q3U827 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf180Q3U827 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf180Q3U827 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf180Q3U827 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf180Q3U827 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf180Q3U827 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf180Q3U827 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf180Q3U827 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf180Q3U827 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf180Q3U827 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf180Q3U827 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnf180Q3U827 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnf180Q3U827 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnf180Q3U827 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnf180Q3U827 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnf180Q3U827 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnf180Q3U827 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnf180Q3U827 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnf180Q3U827 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnf180Q3U827 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnf180Q3U827 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf180Q3U827 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf180Q3U827 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf180Q3U827 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf180Q3U827 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf180Q3U827 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf180Q3U827 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf180Q3U827 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf180Q3U827 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf180Q3U827 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf180Q3U827 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rnf180Q3U827 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rnf180Q3U827 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms