Protein–RNA interactions for Protein: Q3U7U4

Transmembrane protein C1orf162 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U7U4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3U7U4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3U7U4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3U7U4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3U7U4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3U7U4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3U7U4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3U7U4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3U7U4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3U7U4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3U7U4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3U7U4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3U7U4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3U7U4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3U7U4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3U7U4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3U7U4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3U7U4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3U7U4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3U7U4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3U7U4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3U7U4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3U7U4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3U7U4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3U7U4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3U7U4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3U7U4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3U7U4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3U7U4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3U7U4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3U7U4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3U7U4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q3U7U4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q3U7U4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q3U7U4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q3U7U4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q3U7U4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q3U7U4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q3U7U4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q3U7U4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q3U7U4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q3U7U4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q3U7U4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q3U7U4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q3U7U4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q3U7U4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q3U7U4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q3U7U4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q3U7U4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q3U7U4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q3U7U4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q3U7U4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q3U7U4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3U7U4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3U7U4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3U7U4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3U7U4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3U7U4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3U7U4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3U7U4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3U7U4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3U7U4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3U7U4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3U7U4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3U7U4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3U7U4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3U7U4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3U7U4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3U7U4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3U7U4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3U7U4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3U7U4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3U7U4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3U7U4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3U7U4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3U7U4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3U7U4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3U7U4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3U7U4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3U7U4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3U7U4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3U7U4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3U7U4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3U7U4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3U7U4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3U7U4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3U7U4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3U7U4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3U7U4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3U7U4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3U7U4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3U7U4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3U7U4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3U7U4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3U7U4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3U7U4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3U7U4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3U7U4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3U7U4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3U7U4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms