Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q3U6N9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q3U6N9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q3U6N9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q3U6N9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q3U6N9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q3U6N9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q3U6N9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q3U6N9 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q3U6N9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Q3U6N9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q3U6N9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q3U6N9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q3U6N9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q3U6N9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q3U6N9 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Q3U6N9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q3U6N9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q3U6N9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q3U6N9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q3U6N9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q3U6N9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q3U6N9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q3U6N9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q3U6N9 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q3U6N9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q3U6N9 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Q3U6N9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q3U6N9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q3U6N9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q3U6N9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q3U6N9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q3U6N9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q3U6N9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q3U6N9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Q3U6N9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3U6N9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3U6N9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3U6N9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3U6N9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3U6N9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3U6N9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3U6N9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3U6N9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3U6N9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3U6N9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3U6N9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3U6N9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3U6N9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3U6N9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3U6N9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3U6N9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3U6N9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3U6N9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3U6N9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3U6N9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3U6N9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3U6N9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3U6N9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3U6N9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3U6N9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3U6N9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3U6N9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3U6N9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3U6N9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3U6N9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3U6N9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3U6N9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3U6N9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3U6N9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3U6N9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3U6N9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3U6N9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3U6N9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3U6N9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3U6N9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3U6N9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3U6N9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3U6N9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3U6N9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3U6N9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3U6N9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3U6N9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3U6N9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3U6N9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3U6N9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3U6N9 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3U6N9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3U6N9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3U6N9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3U6N9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3U6N9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3U6N9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3U6N9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3U6N9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3U6N9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3U6N9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3U6N9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3U6N9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3U6N9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms