Protein–RNA interactions for Protein: Q3U515

Vwce, von Willebrand factor C and EGF domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VwceQ3U515 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VwceQ3U515 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VwceQ3U515 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VwceQ3U515 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VwceQ3U515 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VwceQ3U515 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VwceQ3U515 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VwceQ3U515 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
VwceQ3U515 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VwceQ3U515 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VwceQ3U515 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
VwceQ3U515 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VwceQ3U515 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VwceQ3U515 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VwceQ3U515 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VwceQ3U515 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VwceQ3U515 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VwceQ3U515 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VwceQ3U515 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VwceQ3U515 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VwceQ3U515 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VwceQ3U515 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
VwceQ3U515 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VwceQ3U515 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VwceQ3U515 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VwceQ3U515 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VwceQ3U515 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VwceQ3U515 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VwceQ3U515 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VwceQ3U515 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VwceQ3U515 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VwceQ3U515 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VwceQ3U515 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VwceQ3U515 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VwceQ3U515 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
VwceQ3U515 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
VwceQ3U515 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VwceQ3U515 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VwceQ3U515 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VwceQ3U515 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VwceQ3U515 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VwceQ3U515 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VwceQ3U515 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VwceQ3U515 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
VwceQ3U515 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
VwceQ3U515 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
VwceQ3U515 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VwceQ3U515 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VwceQ3U515 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VwceQ3U515 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
VwceQ3U515 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VwceQ3U515 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
VwceQ3U515 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VwceQ3U515 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VwceQ3U515 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VwceQ3U515 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VwceQ3U515 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VwceQ3U515 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VwceQ3U515 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VwceQ3U515 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VwceQ3U515 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VwceQ3U515 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VwceQ3U515 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VwceQ3U515 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VwceQ3U515 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VwceQ3U515 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VwceQ3U515 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VwceQ3U515 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
VwceQ3U515 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VwceQ3U515 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VwceQ3U515 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VwceQ3U515 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VwceQ3U515 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VwceQ3U515 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
VwceQ3U515 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
VwceQ3U515 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VwceQ3U515 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VwceQ3U515 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VwceQ3U515 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VwceQ3U515 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VwceQ3U515 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VwceQ3U515 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VwceQ3U515 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VwceQ3U515 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
VwceQ3U515 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VwceQ3U515 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VwceQ3U515 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VwceQ3U515 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VwceQ3U515 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VwceQ3U515 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VwceQ3U515 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VwceQ3U515 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VwceQ3U515 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VwceQ3U515 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VwceQ3U515 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
VwceQ3U515 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VwceQ3U515 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
VwceQ3U515 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VwceQ3U515 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VwceQ3U515 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms