Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Otud5Q3U2S4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Otud5Q3U2S4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Otud5Q3U2S4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Otud5Q3U2S4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Otud5Q3U2S4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Otud5Q3U2S4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Otud5Q3U2S4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Otud5Q3U2S4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Otud5Q3U2S4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Otud5Q3U2S4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Otud5Q3U2S4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Otud5Q3U2S4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Otud5Q3U2S4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Otud5Q3U2S4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Otud5Q3U2S4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Otud5Q3U2S4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Otud5Q3U2S4 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Otud5Q3U2S4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Otud5Q3U2S4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Otud5Q3U2S4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Otud5Q3U2S4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Otud5Q3U2S4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Otud5Q3U2S4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Otud5Q3U2S4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Otud5Q3U2S4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Otud5Q3U2S4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Otud5Q3U2S4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Otud5Q3U2S4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Otud5Q3U2S4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Otud5Q3U2S4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Otud5Q3U2S4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Otud5Q3U2S4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Otud5Q3U2S4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Otud5Q3U2S4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Otud5Q3U2S4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Otud5Q3U2S4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Otud5Q3U2S4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Otud5Q3U2S4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Otud5Q3U2S4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Otud5Q3U2S4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Otud5Q3U2S4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Otud5Q3U2S4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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Otud5Q3U2S4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Otud5Q3U2S4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Otud5Q3U2S4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Otud5Q3U2S4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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Otud5Q3U2S4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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Otud5Q3U2S4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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Otud5Q3U2S4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Otud5Q3U2S4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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Otud5Q3U2S4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Otud5Q3U2S4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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Otud5Q3U2S4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Otud5Q3U2S4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Otud5Q3U2S4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Otud5Q3U2S4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Otud5Q3U2S4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Otud5Q3U2S4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Otud5Q3U2S4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Otud5Q3U2S4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Otud5Q3U2S4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Otud5Q3U2S4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Otud5Q3U2S4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Otud5Q3U2S4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Otud5Q3U2S4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Otud5Q3U2S4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Otud5Q3U2S4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Otud5Q3U2S4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Otud5Q3U2S4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Otud5Q3U2S4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Otud5Q3U2S4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Otud5Q3U2S4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Otud5Q3U2S4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Otud5Q3U2S4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Otud5Q3U2S4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Otud5Q3U2S4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Otud5Q3U2S4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Otud5Q3U2S4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Otud5Q3U2S4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Otud5Q3U2S4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Otud5Q3U2S4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms