Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2A8

Vars2, Valine--tRNA ligase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vars2Q3U2A8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vars2Q3U2A8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vars2Q3U2A8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Vars2Q3U2A8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vars2Q3U2A8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vars2Q3U2A8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vars2Q3U2A8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vars2Q3U2A8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vars2Q3U2A8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vars2Q3U2A8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vars2Q3U2A8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vars2Q3U2A8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vars2Q3U2A8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vars2Q3U2A8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vars2Q3U2A8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Vars2Q3U2A8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vars2Q3U2A8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vars2Q3U2A8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vars2Q3U2A8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Vars2Q3U2A8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vars2Q3U2A8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vars2Q3U2A8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vars2Q3U2A8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vars2Q3U2A8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vars2Q3U2A8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vars2Q3U2A8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vars2Q3U2A8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vars2Q3U2A8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vars2Q3U2A8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vars2Q3U2A8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vars2Q3U2A8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vars2Q3U2A8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vars2Q3U2A8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vars2Q3U2A8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vars2Q3U2A8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vars2Q3U2A8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vars2Q3U2A8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vars2Q3U2A8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vars2Q3U2A8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vars2Q3U2A8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vars2Q3U2A8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vars2Q3U2A8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vars2Q3U2A8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vars2Q3U2A8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vars2Q3U2A8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vars2Q3U2A8 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vars2Q3U2A8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vars2Q3U2A8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Vars2Q3U2A8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vars2Q3U2A8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Vars2Q3U2A8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vars2Q3U2A8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vars2Q3U2A8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vars2Q3U2A8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vars2Q3U2A8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vars2Q3U2A8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vars2Q3U2A8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vars2Q3U2A8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vars2Q3U2A8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vars2Q3U2A8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vars2Q3U2A8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vars2Q3U2A8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vars2Q3U2A8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vars2Q3U2A8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vars2Q3U2A8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vars2Q3U2A8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vars2Q3U2A8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Vars2Q3U2A8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vars2Q3U2A8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vars2Q3U2A8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vars2Q3U2A8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vars2Q3U2A8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vars2Q3U2A8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vars2Q3U2A8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vars2Q3U2A8 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Vars2Q3U2A8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vars2Q3U2A8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Vars2Q3U2A8 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vars2Q3U2A8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vars2Q3U2A8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vars2Q3U2A8 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Vars2Q3U2A8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vars2Q3U2A8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vars2Q3U2A8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vars2Q3U2A8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vars2Q3U2A8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Vars2Q3U2A8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vars2Q3U2A8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vars2Q3U2A8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Vars2Q3U2A8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vars2Q3U2A8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vars2Q3U2A8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vars2Q3U2A8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vars2Q3U2A8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vars2Q3U2A8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vars2Q3U2A8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vars2Q3U2A8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vars2Q3U2A8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vars2Q3U2A8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vars2Q3U2A8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms