Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc174Q3U155 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc174Q3U155 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc174Q3U155 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc174Q3U155 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc174Q3U155 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc174Q3U155 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc174Q3U155 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc174Q3U155 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc174Q3U155 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc174Q3U155 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc174Q3U155 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc174Q3U155 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc174Q3U155 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc174Q3U155 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc174Q3U155 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc174Q3U155 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc174Q3U155 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc174Q3U155 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc174Q3U155 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc174Q3U155 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc174Q3U155 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc174Q3U155 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc174Q3U155 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc174Q3U155 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc174Q3U155 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc174Q3U155 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc174Q3U155 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc174Q3U155 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc174Q3U155 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc174Q3U155 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc174Q3U155 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc174Q3U155 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc174Q3U155 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc174Q3U155 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc174Q3U155 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc174Q3U155 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc174Q3U155 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc174Q3U155 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc174Q3U155 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc174Q3U155 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc174Q3U155 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc174Q3U155 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc174Q3U155 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc174Q3U155 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc174Q3U155 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc174Q3U155 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc174Q3U155 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc174Q3U155 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc174Q3U155 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc174Q3U155 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc174Q3U155 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc174Q3U155 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc174Q3U155 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc174Q3U155 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc174Q3U155 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc174Q3U155 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc174Q3U155 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc174Q3U155 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc174Q3U155 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc174Q3U155 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc174Q3U155 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc174Q3U155 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc174Q3U155 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc174Q3U155 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc174Q3U155 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc174Q3U155 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc174Q3U155 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc174Q3U155 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc174Q3U155 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc174Q3U155 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc174Q3U155 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc174Q3U155 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc174Q3U155 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Ccdc174Q3U155 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ccdc174Q3U155 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc174Q3U155 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc174Q3U155 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc174Q3U155 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc174Q3U155 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc174Q3U155 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc174Q3U155 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc174Q3U155 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc174Q3U155 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc174Q3U155 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc174Q3U155 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc174Q3U155 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc174Q3U155 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc174Q3U155 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc174Q3U155 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc174Q3U155 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc174Q3U155 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc174Q3U155 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc174Q3U155 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc174Q3U155 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc174Q3U155 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc174Q3U155 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc174Q3U155 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc174Q3U155 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc174Q3U155 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms