Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trappc9Q3U0M1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trappc9Q3U0M1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trappc9Q3U0M1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trappc9Q3U0M1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trappc9Q3U0M1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trappc9Q3U0M1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trappc9Q3U0M1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trappc9Q3U0M1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trappc9Q3U0M1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trappc9Q3U0M1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trappc9Q3U0M1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trappc9Q3U0M1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trappc9Q3U0M1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trappc9Q3U0M1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trappc9Q3U0M1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trappc9Q3U0M1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trappc9Q3U0M1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trappc9Q3U0M1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trappc9Q3U0M1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trappc9Q3U0M1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trappc9Q3U0M1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trappc9Q3U0M1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trappc9Q3U0M1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trappc9Q3U0M1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trappc9Q3U0M1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trappc9Q3U0M1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trappc9Q3U0M1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trappc9Q3U0M1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trappc9Q3U0M1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trappc9Q3U0M1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trappc9Q3U0M1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trappc9Q3U0M1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trappc9Q3U0M1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trappc9Q3U0M1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trappc9Q3U0M1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trappc9Q3U0M1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trappc9Q3U0M1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trappc9Q3U0M1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trappc9Q3U0M1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Trappc9Q3U0M1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Trappc9Q3U0M1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Trappc9Q3U0M1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trappc9Q3U0M1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trappc9Q3U0M1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trappc9Q3U0M1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trappc9Q3U0M1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Trappc9Q3U0M1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Trappc9Q3U0M1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trappc9Q3U0M1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trappc9Q3U0M1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trappc9Q3U0M1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trappc9Q3U0M1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trappc9Q3U0M1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trappc9Q3U0M1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trappc9Q3U0M1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trappc9Q3U0M1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trappc9Q3U0M1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trappc9Q3U0M1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trappc9Q3U0M1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Trappc9Q3U0M1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trappc9Q3U0M1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trappc9Q3U0M1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trappc9Q3U0M1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trappc9Q3U0M1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trappc9Q3U0M1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trappc9Q3U0M1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trappc9Q3U0M1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trappc9Q3U0M1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trappc9Q3U0M1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trappc9Q3U0M1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trappc9Q3U0M1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trappc9Q3U0M1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trappc9Q3U0M1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trappc9Q3U0M1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trappc9Q3U0M1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trappc9Q3U0M1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trappc9Q3U0M1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trappc9Q3U0M1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trappc9Q3U0M1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trappc9Q3U0M1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trappc9Q3U0M1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trappc9Q3U0M1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trappc9Q3U0M1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trappc9Q3U0M1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trappc9Q3U0M1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trappc9Q3U0M1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trappc9Q3U0M1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trappc9Q3U0M1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trappc9Q3U0M1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trappc9Q3U0M1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trappc9Q3U0M1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trappc9Q3U0M1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trappc9Q3U0M1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trappc9Q3U0M1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trappc9Q3U0M1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trappc9Q3U0M1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trappc9Q3U0M1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trappc9Q3U0M1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trappc9Q3U0M1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms