Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX08

Trmt1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt1Q3TX08 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trmt1Q3TX08 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trmt1Q3TX08 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Trmt1Q3TX08 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trmt1Q3TX08 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trmt1Q3TX08 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trmt1Q3TX08 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trmt1Q3TX08 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trmt1Q3TX08 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trmt1Q3TX08 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trmt1Q3TX08 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trmt1Q3TX08 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trmt1Q3TX08 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trmt1Q3TX08 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trmt1Q3TX08 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trmt1Q3TX08 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Trmt1Q3TX08 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Trmt1Q3TX08 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Trmt1Q3TX08 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trmt1Q3TX08 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trmt1Q3TX08 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trmt1Q3TX08 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trmt1Q3TX08 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trmt1Q3TX08 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trmt1Q3TX08 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trmt1Q3TX08 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trmt1Q3TX08 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Trmt1Q3TX08 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trmt1Q3TX08 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trmt1Q3TX08 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Trmt1Q3TX08 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trmt1Q3TX08 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trmt1Q3TX08 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trmt1Q3TX08 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trmt1Q3TX08 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trmt1Q3TX08 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trmt1Q3TX08 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trmt1Q3TX08 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trmt1Q3TX08 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trmt1Q3TX08 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trmt1Q3TX08 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trmt1Q3TX08 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trmt1Q3TX08 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trmt1Q3TX08 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trmt1Q3TX08 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trmt1Q3TX08 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trmt1Q3TX08 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trmt1Q3TX08 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trmt1Q3TX08 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trmt1Q3TX08 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trmt1Q3TX08 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trmt1Q3TX08 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trmt1Q3TX08 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trmt1Q3TX08 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trmt1Q3TX08 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trmt1Q3TX08 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Trmt1Q3TX08 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trmt1Q3TX08 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trmt1Q3TX08 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trmt1Q3TX08 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trmt1Q3TX08 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trmt1Q3TX08 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trmt1Q3TX08 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trmt1Q3TX08 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trmt1Q3TX08 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trmt1Q3TX08 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Trmt1Q3TX08 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trmt1Q3TX08 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trmt1Q3TX08 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trmt1Q3TX08 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trmt1Q3TX08 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trmt1Q3TX08 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trmt1Q3TX08 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trmt1Q3TX08 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trmt1Q3TX08 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trmt1Q3TX08 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trmt1Q3TX08 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trmt1Q3TX08 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trmt1Q3TX08 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trmt1Q3TX08 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trmt1Q3TX08 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Trmt1Q3TX08 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trmt1Q3TX08 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trmt1Q3TX08 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trmt1Q3TX08 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Trmt1Q3TX08 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trmt1Q3TX08 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Trmt1Q3TX08 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trmt1Q3TX08 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trmt1Q3TX08 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trmt1Q3TX08 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trmt1Q3TX08 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trmt1Q3TX08 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trmt1Q3TX08 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trmt1Q3TX08 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trmt1Q3TX08 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trmt1Q3TX08 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Trmt1Q3TX08 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trmt1Q3TX08 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trmt1Q3TX08 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms