Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTL0

Uncharacterized protein C3orf38 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTL0 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3TTL0 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3TTL0 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3TTL0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3TTL0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3TTL0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3TTL0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3TTL0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3TTL0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3TTL0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3TTL0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q3TTL0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q3TTL0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q3TTL0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Q3TTL0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Q3TTL0 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q3TTL0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q3TTL0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q3TTL0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q3TTL0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q3TTL0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Q3TTL0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q3TTL0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q3TTL0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q3TTL0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q3TTL0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3TTL0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3TTL0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3TTL0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3TTL0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3TTL0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3TTL0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3TTL0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3TTL0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3TTL0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3TTL0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3TTL0 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3TTL0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3TTL0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3TTL0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3TTL0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3TTL0 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3TTL0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3TTL0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3TTL0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3TTL0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3TTL0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3TTL0 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3TTL0 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3TTL0 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3TTL0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3TTL0 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3TTL0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3TTL0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3TTL0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3TTL0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3TTL0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3TTL0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3TTL0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3TTL0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3TTL0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3TTL0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3TTL0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3TTL0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3TTL0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3TTL0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3TTL0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3TTL0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3TTL0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3TTL0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3TTL0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3TTL0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3TTL0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3TTL0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3TTL0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3TTL0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3TTL0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3TTL0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3TTL0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3TTL0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3TTL0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3TTL0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3TTL0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3TTL0 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3TTL0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3TTL0 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3TTL0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3TTL0 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3TTL0 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3TTL0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3TTL0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3TTL0 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3TTL0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3TTL0 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3TTL0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3TTL0 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3TTL0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3TTL0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3TTL0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3TTL0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms