Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc102aQ3TMW1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc102aQ3TMW1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc102aQ3TMW1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc102aQ3TMW1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc102aQ3TMW1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc102aQ3TMW1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc102aQ3TMW1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc102aQ3TMW1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc102aQ3TMW1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc102aQ3TMW1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc102aQ3TMW1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc102aQ3TMW1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc102aQ3TMW1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc102aQ3TMW1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc102aQ3TMW1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc102aQ3TMW1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc102aQ3TMW1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc102aQ3TMW1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc102aQ3TMW1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc102aQ3TMW1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc102aQ3TMW1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc102aQ3TMW1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc102aQ3TMW1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc102aQ3TMW1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc102aQ3TMW1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc102aQ3TMW1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc102aQ3TMW1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc102aQ3TMW1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc102aQ3TMW1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc102aQ3TMW1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc102aQ3TMW1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc102aQ3TMW1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc102aQ3TMW1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc102aQ3TMW1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc102aQ3TMW1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc102aQ3TMW1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc102aQ3TMW1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc102aQ3TMW1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc102aQ3TMW1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc102aQ3TMW1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc102aQ3TMW1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc102aQ3TMW1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc102aQ3TMW1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc102aQ3TMW1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc102aQ3TMW1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc102aQ3TMW1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc102aQ3TMW1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc102aQ3TMW1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc102aQ3TMW1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc102aQ3TMW1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc102aQ3TMW1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc102aQ3TMW1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc102aQ3TMW1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc102aQ3TMW1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc102aQ3TMW1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc102aQ3TMW1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc102aQ3TMW1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc102aQ3TMW1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc102aQ3TMW1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc102aQ3TMW1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc102aQ3TMW1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc102aQ3TMW1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc102aQ3TMW1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc102aQ3TMW1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc102aQ3TMW1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc102aQ3TMW1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc102aQ3TMW1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc102aQ3TMW1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc102aQ3TMW1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc102aQ3TMW1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc102aQ3TMW1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc102aQ3TMW1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc102aQ3TMW1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc102aQ3TMW1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc102aQ3TMW1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc102aQ3TMW1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc102aQ3TMW1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc102aQ3TMW1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc102aQ3TMW1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc102aQ3TMW1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc102aQ3TMW1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc102aQ3TMW1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc102aQ3TMW1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc102aQ3TMW1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc102aQ3TMW1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc102aQ3TMW1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc102aQ3TMW1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc102aQ3TMW1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc102aQ3TMW1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc102aQ3TMW1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc102aQ3TMW1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc102aQ3TMW1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc102aQ3TMW1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc102aQ3TMW1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc102aQ3TMW1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc102aQ3TMW1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms