Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYK4

Vrtn, Vertnin, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VrtnQ3SYK4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VrtnQ3SYK4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VrtnQ3SYK4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VrtnQ3SYK4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VrtnQ3SYK4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VrtnQ3SYK4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VrtnQ3SYK4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VrtnQ3SYK4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VrtnQ3SYK4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VrtnQ3SYK4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VrtnQ3SYK4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VrtnQ3SYK4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VrtnQ3SYK4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VrtnQ3SYK4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
VrtnQ3SYK4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VrtnQ3SYK4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VrtnQ3SYK4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VrtnQ3SYK4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VrtnQ3SYK4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VrtnQ3SYK4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VrtnQ3SYK4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VrtnQ3SYK4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VrtnQ3SYK4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VrtnQ3SYK4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VrtnQ3SYK4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VrtnQ3SYK4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
VrtnQ3SYK4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VrtnQ3SYK4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
VrtnQ3SYK4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VrtnQ3SYK4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
VrtnQ3SYK4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VrtnQ3SYK4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VrtnQ3SYK4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VrtnQ3SYK4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
VrtnQ3SYK4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VrtnQ3SYK4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VrtnQ3SYK4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VrtnQ3SYK4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VrtnQ3SYK4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VrtnQ3SYK4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
VrtnQ3SYK4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VrtnQ3SYK4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VrtnQ3SYK4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VrtnQ3SYK4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
VrtnQ3SYK4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VrtnQ3SYK4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VrtnQ3SYK4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VrtnQ3SYK4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VrtnQ3SYK4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VrtnQ3SYK4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VrtnQ3SYK4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VrtnQ3SYK4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VrtnQ3SYK4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VrtnQ3SYK4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VrtnQ3SYK4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VrtnQ3SYK4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VrtnQ3SYK4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VrtnQ3SYK4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VrtnQ3SYK4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VrtnQ3SYK4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VrtnQ3SYK4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VrtnQ3SYK4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VrtnQ3SYK4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VrtnQ3SYK4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VrtnQ3SYK4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VrtnQ3SYK4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VrtnQ3SYK4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VrtnQ3SYK4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VrtnQ3SYK4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VrtnQ3SYK4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VrtnQ3SYK4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VrtnQ3SYK4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VrtnQ3SYK4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VrtnQ3SYK4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VrtnQ3SYK4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VrtnQ3SYK4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VrtnQ3SYK4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VrtnQ3SYK4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VrtnQ3SYK4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VrtnQ3SYK4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VrtnQ3SYK4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VrtnQ3SYK4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VrtnQ3SYK4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VrtnQ3SYK4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VrtnQ3SYK4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VrtnQ3SYK4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VrtnQ3SYK4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VrtnQ3SYK4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VrtnQ3SYK4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
VrtnQ3SYK4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VrtnQ3SYK4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VrtnQ3SYK4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VrtnQ3SYK4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VrtnQ3SYK4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VrtnQ3SYK4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VrtnQ3SYK4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VrtnQ3SYK4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VrtnQ3SYK4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VrtnQ3SYK4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VrtnQ3SYK4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms