Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccbe1Q3MI99 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccbe1Q3MI99 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccbe1Q3MI99 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccbe1Q3MI99 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccbe1Q3MI99 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccbe1Q3MI99 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccbe1Q3MI99 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccbe1Q3MI99 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccbe1Q3MI99 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccbe1Q3MI99 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccbe1Q3MI99 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccbe1Q3MI99 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccbe1Q3MI99 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccbe1Q3MI99 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccbe1Q3MI99 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccbe1Q3MI99 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccbe1Q3MI99 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccbe1Q3MI99 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccbe1Q3MI99 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccbe1Q3MI99 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccbe1Q3MI99 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccbe1Q3MI99 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccbe1Q3MI99 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccbe1Q3MI99 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccbe1Q3MI99 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccbe1Q3MI99 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccbe1Q3MI99 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccbe1Q3MI99 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccbe1Q3MI99 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccbe1Q3MI99 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccbe1Q3MI99 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccbe1Q3MI99 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccbe1Q3MI99 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccbe1Q3MI99 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccbe1Q3MI99 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccbe1Q3MI99 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccbe1Q3MI99 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccbe1Q3MI99 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccbe1Q3MI99 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccbe1Q3MI99 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccbe1Q3MI99 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccbe1Q3MI99 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccbe1Q3MI99 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccbe1Q3MI99 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccbe1Q3MI99 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccbe1Q3MI99 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccbe1Q3MI99 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccbe1Q3MI99 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccbe1Q3MI99 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccbe1Q3MI99 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccbe1Q3MI99 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccbe1Q3MI99 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccbe1Q3MI99 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccbe1Q3MI99 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccbe1Q3MI99 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccbe1Q3MI99 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccbe1Q3MI99 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccbe1Q3MI99 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccbe1Q3MI99 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccbe1Q3MI99 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccbe1Q3MI99 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccbe1Q3MI99 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccbe1Q3MI99 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccbe1Q3MI99 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccbe1Q3MI99 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccbe1Q3MI99 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccbe1Q3MI99 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccbe1Q3MI99 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccbe1Q3MI99 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccbe1Q3MI99 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccbe1Q3MI99 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccbe1Q3MI99 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccbe1Q3MI99 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccbe1Q3MI99 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccbe1Q3MI99 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccbe1Q3MI99 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccbe1Q3MI99 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccbe1Q3MI99 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccbe1Q3MI99 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccbe1Q3MI99 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccbe1Q3MI99 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccbe1Q3MI99 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccbe1Q3MI99 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccbe1Q3MI99 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccbe1Q3MI99 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms