Protein–RNA interactions for Protein: Q32NY4

Cnnm3, Metal transporter CNNM3, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm3Q32NY4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnnm3Q32NY4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnnm3Q32NY4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnnm3Q32NY4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnnm3Q32NY4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnnm3Q32NY4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnnm3Q32NY4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnnm3Q32NY4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnnm3Q32NY4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnnm3Q32NY4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnnm3Q32NY4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnnm3Q32NY4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnnm3Q32NY4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnnm3Q32NY4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnnm3Q32NY4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnnm3Q32NY4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnnm3Q32NY4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnnm3Q32NY4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnnm3Q32NY4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnnm3Q32NY4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnnm3Q32NY4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnnm3Q32NY4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnnm3Q32NY4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnnm3Q32NY4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnnm3Q32NY4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnnm3Q32NY4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnnm3Q32NY4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnnm3Q32NY4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnnm3Q32NY4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnnm3Q32NY4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnnm3Q32NY4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnnm3Q32NY4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnnm3Q32NY4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnnm3Q32NY4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnnm3Q32NY4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnnm3Q32NY4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnnm3Q32NY4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnnm3Q32NY4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnnm3Q32NY4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnnm3Q32NY4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnnm3Q32NY4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnnm3Q32NY4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnnm3Q32NY4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnnm3Q32NY4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnnm3Q32NY4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnnm3Q32NY4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnnm3Q32NY4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnnm3Q32NY4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnnm3Q32NY4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnnm3Q32NY4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnnm3Q32NY4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnnm3Q32NY4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnnm3Q32NY4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnnm3Q32NY4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnnm3Q32NY4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnnm3Q32NY4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnnm3Q32NY4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnnm3Q32NY4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnnm3Q32NY4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnnm3Q32NY4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnnm3Q32NY4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnnm3Q32NY4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnnm3Q32NY4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnnm3Q32NY4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnnm3Q32NY4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnnm3Q32NY4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnnm3Q32NY4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnnm3Q32NY4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnnm3Q32NY4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnnm3Q32NY4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnnm3Q32NY4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnnm3Q32NY4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnnm3Q32NY4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnnm3Q32NY4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnnm3Q32NY4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnnm3Q32NY4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnnm3Q32NY4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnnm3Q32NY4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnnm3Q32NY4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnnm3Q32NY4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnnm3Q32NY4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnnm3Q32NY4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnnm3Q32NY4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnnm3Q32NY4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnnm3Q32NY4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnnm3Q32NY4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnnm3Q32NY4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnnm3Q32NY4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnnm3Q32NY4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnnm3Q32NY4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnnm3Q32NY4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnnm3Q32NY4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnnm3Q32NY4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnnm3Q32NY4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnnm3Q32NY4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnnm3Q32NY4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnnm3Q32NY4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnnm3Q32NY4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnnm3Q32NY4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnnm3Q32NY4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms