Protein–RNA interactions for Protein: Q2TV84

Trpm1, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm1Q2TV84 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Trpm1Q2TV84 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Trpm1Q2TV84 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Trpm1Q2TV84 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Trpm1Q2TV84 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Trpm1Q2TV84 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Trpm1Q2TV84 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Trpm1Q2TV84 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Trpm1Q2TV84 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Trpm1Q2TV84 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trpm1Q2TV84 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trpm1Q2TV84 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trpm1Q2TV84 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trpm1Q2TV84 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trpm1Q2TV84 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trpm1Q2TV84 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trpm1Q2TV84 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trpm1Q2TV84 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trpm1Q2TV84 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trpm1Q2TV84 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trpm1Q2TV84 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trpm1Q2TV84 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trpm1Q2TV84 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trpm1Q2TV84 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trpm1Q2TV84 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trpm1Q2TV84 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trpm1Q2TV84 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trpm1Q2TV84 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trpm1Q2TV84 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Trpm1Q2TV84 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Trpm1Q2TV84 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Trpm1Q2TV84 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Trpm1Q2TV84 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Trpm1Q2TV84 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Trpm1Q2TV84 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trpm1Q2TV84 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trpm1Q2TV84 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trpm1Q2TV84 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trpm1Q2TV84 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trpm1Q2TV84 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Trpm1Q2TV84 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trpm1Q2TV84 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trpm1Q2TV84 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trpm1Q2TV84 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Trpm1Q2TV84 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trpm1Q2TV84 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trpm1Q2TV84 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trpm1Q2TV84 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trpm1Q2TV84 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trpm1Q2TV84 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trpm1Q2TV84 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trpm1Q2TV84 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trpm1Q2TV84 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trpm1Q2TV84 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trpm1Q2TV84 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trpm1Q2TV84 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trpm1Q2TV84 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Trpm1Q2TV84 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trpm1Q2TV84 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trpm1Q2TV84 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trpm1Q2TV84 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trpm1Q2TV84 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Trpm1Q2TV84 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Trpm1Q2TV84 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Trpm1Q2TV84 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Trpm1Q2TV84 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Trpm1Q2TV84 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Trpm1Q2TV84 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trpm1Q2TV84 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trpm1Q2TV84 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trpm1Q2TV84 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trpm1Q2TV84 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trpm1Q2TV84 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trpm1Q2TV84 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trpm1Q2TV84 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trpm1Q2TV84 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trpm1Q2TV84 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trpm1Q2TV84 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trpm1Q2TV84 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trpm1Q2TV84 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trpm1Q2TV84 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trpm1Q2TV84 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trpm1Q2TV84 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trpm1Q2TV84 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Trpm1Q2TV84 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trpm1Q2TV84 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trpm1Q2TV84 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trpm1Q2TV84 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trpm1Q2TV84 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trpm1Q2TV84 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trpm1Q2TV84 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trpm1Q2TV84 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trpm1Q2TV84 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trpm1Q2TV84 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Trpm1Q2TV84 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Trpm1Q2TV84 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Trpm1Q2TV84 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Trpm1Q2TV84 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Trpm1Q2TV84 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Trpm1Q2TV84 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.3 ms