Protein–RNA interactions for Protein: Q2TJ95

Rspo3, R-spondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rspo3Q2TJ95 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rspo3Q2TJ95 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rspo3Q2TJ95 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rspo3Q2TJ95 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rspo3Q2TJ95 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rspo3Q2TJ95 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Rspo3Q2TJ95 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rspo3Q2TJ95 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rspo3Q2TJ95 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rspo3Q2TJ95 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rspo3Q2TJ95 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rspo3Q2TJ95 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rspo3Q2TJ95 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Rspo3Q2TJ95 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Rspo3Q2TJ95 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rspo3Q2TJ95 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rspo3Q2TJ95 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rspo3Q2TJ95 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rspo3Q2TJ95 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rspo3Q2TJ95 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rspo3Q2TJ95 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rspo3Q2TJ95 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rspo3Q2TJ95 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rspo3Q2TJ95 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rspo3Q2TJ95 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rspo3Q2TJ95 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rspo3Q2TJ95 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rspo3Q2TJ95 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rspo3Q2TJ95 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rspo3Q2TJ95 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rspo3Q2TJ95 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rspo3Q2TJ95 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rspo3Q2TJ95 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rspo3Q2TJ95 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rspo3Q2TJ95 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rspo3Q2TJ95 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rspo3Q2TJ95 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rspo3Q2TJ95 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rspo3Q2TJ95 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rspo3Q2TJ95 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rspo3Q2TJ95 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rspo3Q2TJ95 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rspo3Q2TJ95 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rspo3Q2TJ95 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rspo3Q2TJ95 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rspo3Q2TJ95 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rspo3Q2TJ95 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rspo3Q2TJ95 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rspo3Q2TJ95 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rspo3Q2TJ95 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rspo3Q2TJ95 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rspo3Q2TJ95 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rspo3Q2TJ95 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rspo3Q2TJ95 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rspo3Q2TJ95 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rspo3Q2TJ95 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rspo3Q2TJ95 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rspo3Q2TJ95 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rspo3Q2TJ95 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rspo3Q2TJ95 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rspo3Q2TJ95 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rspo3Q2TJ95 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rspo3Q2TJ95 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rspo3Q2TJ95 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rspo3Q2TJ95 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rspo3Q2TJ95 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rspo3Q2TJ95 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rspo3Q2TJ95 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rspo3Q2TJ95 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rspo3Q2TJ95 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rspo3Q2TJ95 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rspo3Q2TJ95 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rspo3Q2TJ95 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rspo3Q2TJ95 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rspo3Q2TJ95 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rspo3Q2TJ95 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rspo3Q2TJ95 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rspo3Q2TJ95 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rspo3Q2TJ95 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rspo3Q2TJ95 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rspo3Q2TJ95 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rspo3Q2TJ95 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rspo3Q2TJ95 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rspo3Q2TJ95 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rspo3Q2TJ95 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rspo3Q2TJ95 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rspo3Q2TJ95 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rspo3Q2TJ95 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rspo3Q2TJ95 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rspo3Q2TJ95 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rspo3Q2TJ95 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rspo3Q2TJ95 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rspo3Q2TJ95 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rspo3Q2TJ95 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rspo3Q2TJ95 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rspo3Q2TJ95 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rspo3Q2TJ95 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rspo3Q2TJ95 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rspo3Q2TJ95 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rspo3Q2TJ95 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms