Protein–RNA interactions for Protein: Q24JP3

Fam178b, Protein FAM178B, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam178bQ24JP3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam178bQ24JP3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam178bQ24JP3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam178bQ24JP3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam178bQ24JP3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam178bQ24JP3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam178bQ24JP3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam178bQ24JP3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam178bQ24JP3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam178bQ24JP3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam178bQ24JP3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam178bQ24JP3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam178bQ24JP3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam178bQ24JP3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam178bQ24JP3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam178bQ24JP3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam178bQ24JP3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam178bQ24JP3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam178bQ24JP3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam178bQ24JP3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam178bQ24JP3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam178bQ24JP3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam178bQ24JP3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam178bQ24JP3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam178bQ24JP3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam178bQ24JP3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam178bQ24JP3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam178bQ24JP3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam178bQ24JP3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam178bQ24JP3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam178bQ24JP3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam178bQ24JP3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam178bQ24JP3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam178bQ24JP3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam178bQ24JP3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam178bQ24JP3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam178bQ24JP3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam178bQ24JP3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam178bQ24JP3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam178bQ24JP3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam178bQ24JP3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fam178bQ24JP3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fam178bQ24JP3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fam178bQ24JP3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fam178bQ24JP3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fam178bQ24JP3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam178bQ24JP3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam178bQ24JP3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam178bQ24JP3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam178bQ24JP3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam178bQ24JP3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam178bQ24JP3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam178bQ24JP3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam178bQ24JP3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam178bQ24JP3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam178bQ24JP3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam178bQ24JP3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam178bQ24JP3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam178bQ24JP3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam178bQ24JP3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam178bQ24JP3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam178bQ24JP3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam178bQ24JP3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam178bQ24JP3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam178bQ24JP3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam178bQ24JP3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam178bQ24JP3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam178bQ24JP3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam178bQ24JP3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam178bQ24JP3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam178bQ24JP3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam178bQ24JP3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam178bQ24JP3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam178bQ24JP3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam178bQ24JP3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam178bQ24JP3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam178bQ24JP3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam178bQ24JP3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam178bQ24JP3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam178bQ24JP3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam178bQ24JP3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam178bQ24JP3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam178bQ24JP3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam178bQ24JP3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam178bQ24JP3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam178bQ24JP3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam178bQ24JP3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam178bQ24JP3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam178bQ24JP3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam178bQ24JP3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam178bQ24JP3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam178bQ24JP3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam178bQ24JP3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam178bQ24JP3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam178bQ24JP3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam178bQ24JP3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam178bQ24JP3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam178bQ24JP3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam178bQ24JP3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam178bQ24JP3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
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