Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cers3Q1A3B0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cers3Q1A3B0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cers3Q1A3B0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cers3Q1A3B0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cers3Q1A3B0 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Cers3Q1A3B0 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cers3Q1A3B0 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cers3Q1A3B0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cers3Q1A3B0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cers3Q1A3B0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cers3Q1A3B0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cers3Q1A3B0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cers3Q1A3B0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cers3Q1A3B0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cers3Q1A3B0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cers3Q1A3B0 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Cers3Q1A3B0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cers3Q1A3B0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Cers3Q1A3B0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Cers3Q1A3B0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cers3Q1A3B0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Cers3Q1A3B0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cers3Q1A3B0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cers3Q1A3B0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cers3Q1A3B0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Cers3Q1A3B0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cers3Q1A3B0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cers3Q1A3B0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cers3Q1A3B0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cers3Q1A3B0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cers3Q1A3B0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cers3Q1A3B0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cers3Q1A3B0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cers3Q1A3B0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cers3Q1A3B0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cers3Q1A3B0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cers3Q1A3B0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cers3Q1A3B0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cers3Q1A3B0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cers3Q1A3B0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cers3Q1A3B0 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cers3Q1A3B0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cers3Q1A3B0 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cers3Q1A3B0 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cers3Q1A3B0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cers3Q1A3B0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cers3Q1A3B0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cers3Q1A3B0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cers3Q1A3B0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cers3Q1A3B0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cers3Q1A3B0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cers3Q1A3B0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cers3Q1A3B0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cers3Q1A3B0 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cers3Q1A3B0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Cers3Q1A3B0 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cers3Q1A3B0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cers3Q1A3B0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cers3Q1A3B0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cers3Q1A3B0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cers3Q1A3B0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cers3Q1A3B0 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Cers3Q1A3B0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cers3Q1A3B0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cers3Q1A3B0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cers3Q1A3B0 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cers3Q1A3B0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cers3Q1A3B0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Cers3Q1A3B0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cers3Q1A3B0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cers3Q1A3B0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cers3Q1A3B0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cers3Q1A3B0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cers3Q1A3B0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cers3Q1A3B0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cers3Q1A3B0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cers3Q1A3B0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cers3Q1A3B0 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cers3Q1A3B0 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Cers3Q1A3B0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cers3Q1A3B0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cers3Q1A3B0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cers3Q1A3B0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cers3Q1A3B0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cers3Q1A3B0 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cers3Q1A3B0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cers3Q1A3B0 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cers3Q1A3B0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cers3Q1A3B0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cers3Q1A3B0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cers3Q1A3B0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cers3Q1A3B0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cers3Q1A3B0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cers3Q1A3B0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Cers3Q1A3B0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cers3Q1A3B0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cers3Q1A3B0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cers3Q1A3B0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cers3Q1A3B0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
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