Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Traf3ip1Q149C2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Traf3ip1Q149C2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Traf3ip1Q149C2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Traf3ip1Q149C2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Traf3ip1Q149C2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Traf3ip1Q149C2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Traf3ip1Q149C2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Traf3ip1Q149C2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Traf3ip1Q149C2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Traf3ip1Q149C2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Traf3ip1Q149C2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Traf3ip1Q149C2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Traf3ip1Q149C2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Traf3ip1Q149C2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Traf3ip1Q149C2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Traf3ip1Q149C2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Traf3ip1Q149C2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Traf3ip1Q149C2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Traf3ip1Q149C2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Traf3ip1Q149C2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Traf3ip1Q149C2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Traf3ip1Q149C2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Traf3ip1Q149C2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Traf3ip1Q149C2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Traf3ip1Q149C2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Traf3ip1Q149C2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Traf3ip1Q149C2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Traf3ip1Q149C2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Traf3ip1Q149C2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Traf3ip1Q149C2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Traf3ip1Q149C2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Traf3ip1Q149C2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Traf3ip1Q149C2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Traf3ip1Q149C2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Traf3ip1Q149C2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Traf3ip1Q149C2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Traf3ip1Q149C2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Traf3ip1Q149C2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Traf3ip1Q149C2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Traf3ip1Q149C2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Traf3ip1Q149C2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Traf3ip1Q149C2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Traf3ip1Q149C2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Traf3ip1Q149C2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Traf3ip1Q149C2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Traf3ip1Q149C2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Traf3ip1Q149C2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Traf3ip1Q149C2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Traf3ip1Q149C2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Traf3ip1Q149C2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Traf3ip1Q149C2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Traf3ip1Q149C2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Traf3ip1Q149C2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Traf3ip1Q149C2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Traf3ip1Q149C2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Traf3ip1Q149C2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Traf3ip1Q149C2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Traf3ip1Q149C2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Traf3ip1Q149C2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Traf3ip1Q149C2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Traf3ip1Q149C2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Traf3ip1Q149C2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Traf3ip1Q149C2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Traf3ip1Q149C2 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Traf3ip1Q149C2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Traf3ip1Q149C2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Traf3ip1Q149C2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Traf3ip1Q149C2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Traf3ip1Q149C2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Traf3ip1Q149C2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Traf3ip1Q149C2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Traf3ip1Q149C2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Traf3ip1Q149C2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Traf3ip1Q149C2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Traf3ip1Q149C2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Traf3ip1Q149C2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Traf3ip1Q149C2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Traf3ip1Q149C2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Traf3ip1Q149C2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Traf3ip1Q149C2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Traf3ip1Q149C2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Traf3ip1Q149C2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Traf3ip1Q149C2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Traf3ip1Q149C2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Traf3ip1Q149C2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Traf3ip1Q149C2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Traf3ip1Q149C2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Traf3ip1Q149C2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Traf3ip1Q149C2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Traf3ip1Q149C2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Traf3ip1Q149C2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Traf3ip1Q149C2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Traf3ip1Q149C2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Traf3ip1Q149C2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Traf3ip1Q149C2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Traf3ip1Q149C2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Traf3ip1Q149C2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Traf3ip1Q149C2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Traf3ip1Q149C2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
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