Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGB7

Ppp4r2, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r2Q0VGB7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ppp4r2Q0VGB7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ppp4r2Q0VGB7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ppp4r2Q0VGB7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ppp4r2Q0VGB7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppp4r2Q0VGB7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppp4r2Q0VGB7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppp4r2Q0VGB7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppp4r2Q0VGB7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppp4r2Q0VGB7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppp4r2Q0VGB7 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppp4r2Q0VGB7 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppp4r2Q0VGB7 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppp4r2Q0VGB7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppp4r2Q0VGB7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppp4r2Q0VGB7 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppp4r2Q0VGB7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppp4r2Q0VGB7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppp4r2Q0VGB7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppp4r2Q0VGB7 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppp4r2Q0VGB7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppp4r2Q0VGB7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ppp4r2Q0VGB7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ppp4r2Q0VGB7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ppp4r2Q0VGB7 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ppp4r2Q0VGB7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ppp4r2Q0VGB7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ppp4r2Q0VGB7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ppp4r2Q0VGB7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ppp4r2Q0VGB7 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ppp4r2Q0VGB7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ppp4r2Q0VGB7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ppp4r2Q0VGB7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ppp4r2Q0VGB7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ppp4r2Q0VGB7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ppp4r2Q0VGB7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ppp4r2Q0VGB7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppp4r2Q0VGB7 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppp4r2Q0VGB7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppp4r2Q0VGB7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppp4r2Q0VGB7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppp4r2Q0VGB7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppp4r2Q0VGB7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppp4r2Q0VGB7 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppp4r2Q0VGB7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppp4r2Q0VGB7 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppp4r2Q0VGB7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppp4r2Q0VGB7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppp4r2Q0VGB7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppp4r2Q0VGB7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppp4r2Q0VGB7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppp4r2Q0VGB7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ppp4r2Q0VGB7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ppp4r2Q0VGB7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ppp4r2Q0VGB7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ppp4r2Q0VGB7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ppp4r2Q0VGB7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ppp4r2Q0VGB7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ppp4r2Q0VGB7 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ppp4r2Q0VGB7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ppp4r2Q0VGB7 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Ppp4r2Q0VGB7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ppp4r2Q0VGB7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ppp4r2Q0VGB7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ppp4r2Q0VGB7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ppp4r2Q0VGB7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ppp4r2Q0VGB7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Ppp4r2Q0VGB7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ppp4r2Q0VGB7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ppp4r2Q0VGB7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ppp4r2Q0VGB7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ppp4r2Q0VGB7 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ppp4r2Q0VGB7 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ppp4r2Q0VGB7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ppp4r2Q0VGB7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ppp4r2Q0VGB7 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ppp4r2Q0VGB7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ppp4r2Q0VGB7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ppp4r2Q0VGB7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Ppp4r2Q0VGB7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ppp4r2Q0VGB7 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ppp4r2Q0VGB7 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ppp4r2Q0VGB7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ppp4r2Q0VGB7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ppp4r2Q0VGB7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ppp4r2Q0VGB7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ppp4r2Q0VGB7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ppp4r2Q0VGB7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ppp4r2Q0VGB7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ppp4r2Q0VGB7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ppp4r2Q0VGB7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ppp4r2Q0VGB7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ppp4r2Q0VGB7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppp4r2Q0VGB7 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppp4r2Q0VGB7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppp4r2Q0VGB7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppp4r2Q0VGB7 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppp4r2Q0VGB7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppp4r2Q0VGB7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppp4r2Q0VGB7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms