Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc162pQ0VG85 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc162pQ0VG85 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc162pQ0VG85 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc162pQ0VG85 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc162pQ0VG85 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc162pQ0VG85 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc162pQ0VG85 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc162pQ0VG85 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc162pQ0VG85 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc162pQ0VG85 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc162pQ0VG85 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc162pQ0VG85 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc162pQ0VG85 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc162pQ0VG85 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc162pQ0VG85 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc162pQ0VG85 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc162pQ0VG85 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc162pQ0VG85 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc162pQ0VG85 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc162pQ0VG85 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc162pQ0VG85 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc162pQ0VG85 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc162pQ0VG85 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc162pQ0VG85 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc162pQ0VG85 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc162pQ0VG85 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc162pQ0VG85 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc162pQ0VG85 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc162pQ0VG85 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc162pQ0VG85 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc162pQ0VG85 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc162pQ0VG85 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc162pQ0VG85 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc162pQ0VG85 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc162pQ0VG85 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc162pQ0VG85 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc162pQ0VG85 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc162pQ0VG85 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc162pQ0VG85 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc162pQ0VG85 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc162pQ0VG85 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc162pQ0VG85 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc162pQ0VG85 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc162pQ0VG85 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc162pQ0VG85 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc162pQ0VG85 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc162pQ0VG85 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc162pQ0VG85 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc162pQ0VG85 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc162pQ0VG85 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc162pQ0VG85 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc162pQ0VG85 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc162pQ0VG85 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc162pQ0VG85 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc162pQ0VG85 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc162pQ0VG85 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc162pQ0VG85 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc162pQ0VG85 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc162pQ0VG85 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc162pQ0VG85 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc162pQ0VG85 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc162pQ0VG85 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc162pQ0VG85 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc162pQ0VG85 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc162pQ0VG85 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc162pQ0VG85 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc162pQ0VG85 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc162pQ0VG85 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc162pQ0VG85 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc162pQ0VG85 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc162pQ0VG85 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc162pQ0VG85 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc162pQ0VG85 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc162pQ0VG85 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc162pQ0VG85 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc162pQ0VG85 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc162pQ0VG85 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc162pQ0VG85 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc162pQ0VG85 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc162pQ0VG85 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc162pQ0VG85 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc162pQ0VG85 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc162pQ0VG85 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc162pQ0VG85 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc162pQ0VG85 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc162pQ0VG85 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc162pQ0VG85 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc162pQ0VG85 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc162pQ0VG85 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc162pQ0VG85 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc162pQ0VG85 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc162pQ0VG85 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Ccdc162pQ0VG85 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ccdc162pQ0VG85 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc162pQ0VG85 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc162pQ0VG85 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc162pQ0VG85 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc162pQ0VG85 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc162pQ0VG85 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms