Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG18

Smim24, Small integral membrane protein 24, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim24Q0VG18 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smim24Q0VG18 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smim24Q0VG18 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smim24Q0VG18 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smim24Q0VG18 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smim24Q0VG18 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smim24Q0VG18 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smim24Q0VG18 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smim24Q0VG18 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smim24Q0VG18 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smim24Q0VG18 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smim24Q0VG18 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smim24Q0VG18 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smim24Q0VG18 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smim24Q0VG18 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smim24Q0VG18 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smim24Q0VG18 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smim24Q0VG18 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smim24Q0VG18 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smim24Q0VG18 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smim24Q0VG18 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smim24Q0VG18 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smim24Q0VG18 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Smim24Q0VG18 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smim24Q0VG18 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smim24Q0VG18 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms