Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp2b3Q0VF55 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp2b3Q0VF55 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp2b3Q0VF55 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp2b3Q0VF55 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp2b3Q0VF55 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp2b3Q0VF55 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp2b3Q0VF55 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp2b3Q0VF55 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp2b3Q0VF55 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp2b3Q0VF55 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp2b3Q0VF55 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp2b3Q0VF55 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp2b3Q0VF55 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp2b3Q0VF55 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp2b3Q0VF55 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp2b3Q0VF55 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp2b3Q0VF55 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp2b3Q0VF55 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp2b3Q0VF55 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp2b3Q0VF55 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp2b3Q0VF55 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp2b3Q0VF55 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp2b3Q0VF55 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp2b3Q0VF55 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp2b3Q0VF55 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp2b3Q0VF55 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp2b3Q0VF55 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp2b3Q0VF55 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp2b3Q0VF55 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp2b3Q0VF55 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp2b3Q0VF55 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp2b3Q0VF55 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp2b3Q0VF55 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp2b3Q0VF55 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp2b3Q0VF55 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp2b3Q0VF55 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp2b3Q0VF55 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp2b3Q0VF55 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp2b3Q0VF55 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp2b3Q0VF55 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp2b3Q0VF55 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp2b3Q0VF55 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp2b3Q0VF55 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp2b3Q0VF55 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp2b3Q0VF55 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp2b3Q0VF55 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp2b3Q0VF55 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp2b3Q0VF55 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp2b3Q0VF55 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp2b3Q0VF55 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp2b3Q0VF55 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp2b3Q0VF55 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp2b3Q0VF55 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Atp2b3Q0VF55 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Atp2b3Q0VF55 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp2b3Q0VF55 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp2b3Q0VF55 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp2b3Q0VF55 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp2b3Q0VF55 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp2b3Q0VF55 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp2b3Q0VF55 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp2b3Q0VF55 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp2b3Q0VF55 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp2b3Q0VF55 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp2b3Q0VF55 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp2b3Q0VF55 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp2b3Q0VF55 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp2b3Q0VF55 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp2b3Q0VF55 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp2b3Q0VF55 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp2b3Q0VF55 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp2b3Q0VF55 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp2b3Q0VF55 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp2b3Q0VF55 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp2b3Q0VF55 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp2b3Q0VF55 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp2b3Q0VF55 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp2b3Q0VF55 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp2b3Q0VF55 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp2b3Q0VF55 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp2b3Q0VF55 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp2b3Q0VF55 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp2b3Q0VF55 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp2b3Q0VF55 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp2b3Q0VF55 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp2b3Q0VF55 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp2b3Q0VF55 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp2b3Q0VF55 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp2b3Q0VF55 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp2b3Q0VF55 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp2b3Q0VF55 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp2b3Q0VF55 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp2b3Q0VF55 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp2b3Q0VF55 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp2b3Q0VF55 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp2b3Q0VF55 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp2b3Q0VF55 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp2b3Q0VF55 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp2b3Q0VF55 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms