Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBL6

Hif3a, Hypoxia-inducible factor 3-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hif3aQ0VBL6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hif3aQ0VBL6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hif3aQ0VBL6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hif3aQ0VBL6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hif3aQ0VBL6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hif3aQ0VBL6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hif3aQ0VBL6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hif3aQ0VBL6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hif3aQ0VBL6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hif3aQ0VBL6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hif3aQ0VBL6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hif3aQ0VBL6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hif3aQ0VBL6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hif3aQ0VBL6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hif3aQ0VBL6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hif3aQ0VBL6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hif3aQ0VBL6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hif3aQ0VBL6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hif3aQ0VBL6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hif3aQ0VBL6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hif3aQ0VBL6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hif3aQ0VBL6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hif3aQ0VBL6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hif3aQ0VBL6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hif3aQ0VBL6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hif3aQ0VBL6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hif3aQ0VBL6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hif3aQ0VBL6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hif3aQ0VBL6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hif3aQ0VBL6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hif3aQ0VBL6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hif3aQ0VBL6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hif3aQ0VBL6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Hif3aQ0VBL6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hif3aQ0VBL6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hif3aQ0VBL6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hif3aQ0VBL6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hif3aQ0VBL6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hif3aQ0VBL6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hif3aQ0VBL6 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hif3aQ0VBL6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hif3aQ0VBL6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Hif3aQ0VBL6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hif3aQ0VBL6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hif3aQ0VBL6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hif3aQ0VBL6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hif3aQ0VBL6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hif3aQ0VBL6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hif3aQ0VBL6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hif3aQ0VBL6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hif3aQ0VBL6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hif3aQ0VBL6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hif3aQ0VBL6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Hif3aQ0VBL6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hif3aQ0VBL6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hif3aQ0VBL6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hif3aQ0VBL6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hif3aQ0VBL6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hif3aQ0VBL6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hif3aQ0VBL6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hif3aQ0VBL6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hif3aQ0VBL6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Hif3aQ0VBL6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hif3aQ0VBL6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hif3aQ0VBL6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hif3aQ0VBL6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hif3aQ0VBL6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Hif3aQ0VBL6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hif3aQ0VBL6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Hif3aQ0VBL6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hif3aQ0VBL6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hif3aQ0VBL6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hif3aQ0VBL6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hif3aQ0VBL6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hif3aQ0VBL6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hif3aQ0VBL6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hif3aQ0VBL6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hif3aQ0VBL6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hif3aQ0VBL6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hif3aQ0VBL6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hif3aQ0VBL6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hif3aQ0VBL6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hif3aQ0VBL6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hif3aQ0VBL6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hif3aQ0VBL6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hif3aQ0VBL6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hif3aQ0VBL6 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Hif3aQ0VBL6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hif3aQ0VBL6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hif3aQ0VBL6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hif3aQ0VBL6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hif3aQ0VBL6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hif3aQ0VBL6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hif3aQ0VBL6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hif3aQ0VBL6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hif3aQ0VBL6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hif3aQ0VBL6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Hif3aQ0VBL6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hif3aQ0VBL6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hif3aQ0VBL6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms