Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBL1

Tigd2, Tigger transposable element-derived protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tigd2Q0VBL1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tigd2Q0VBL1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tigd2Q0VBL1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tigd2Q0VBL1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tigd2Q0VBL1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tigd2Q0VBL1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tigd2Q0VBL1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tigd2Q0VBL1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tigd2Q0VBL1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tigd2Q0VBL1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tigd2Q0VBL1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tigd2Q0VBL1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tigd2Q0VBL1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tigd2Q0VBL1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tigd2Q0VBL1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Tigd2Q0VBL1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tigd2Q0VBL1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tigd2Q0VBL1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tigd2Q0VBL1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tigd2Q0VBL1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tigd2Q0VBL1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tigd2Q0VBL1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tigd2Q0VBL1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tigd2Q0VBL1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tigd2Q0VBL1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tigd2Q0VBL1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tigd2Q0VBL1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tigd2Q0VBL1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tigd2Q0VBL1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tigd2Q0VBL1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tigd2Q0VBL1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tigd2Q0VBL1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tigd2Q0VBL1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms