Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF2

Tmem52b, Transmembrane protein 52B, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem52bQ0VBF2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem52bQ0VBF2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem52bQ0VBF2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem52bQ0VBF2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem52bQ0VBF2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem52bQ0VBF2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem52bQ0VBF2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem52bQ0VBF2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem52bQ0VBF2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem52bQ0VBF2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem52bQ0VBF2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem52bQ0VBF2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem52bQ0VBF2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem52bQ0VBF2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem52bQ0VBF2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem52bQ0VBF2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem52bQ0VBF2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem52bQ0VBF2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem52bQ0VBF2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem52bQ0VBF2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem52bQ0VBF2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem52bQ0VBF2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem52bQ0VBF2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem52bQ0VBF2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem52bQ0VBF2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem52bQ0VBF2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem52bQ0VBF2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem52bQ0VBF2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem52bQ0VBF2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem52bQ0VBF2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem52bQ0VBF2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem52bQ0VBF2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem52bQ0VBF2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem52bQ0VBF2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem52bQ0VBF2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem52bQ0VBF2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem52bQ0VBF2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem52bQ0VBF2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem52bQ0VBF2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem52bQ0VBF2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem52bQ0VBF2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem52bQ0VBF2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem52bQ0VBF2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem52bQ0VBF2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem52bQ0VBF2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem52bQ0VBF2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem52bQ0VBF2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem52bQ0VBF2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem52bQ0VBF2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem52bQ0VBF2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem52bQ0VBF2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem52bQ0VBF2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem52bQ0VBF2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem52bQ0VBF2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem52bQ0VBF2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem52bQ0VBF2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem52bQ0VBF2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem52bQ0VBF2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem52bQ0VBF2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem52bQ0VBF2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem52bQ0VBF2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem52bQ0VBF2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem52bQ0VBF2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem52bQ0VBF2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem52bQ0VBF2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem52bQ0VBF2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem52bQ0VBF2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem52bQ0VBF2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem52bQ0VBF2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem52bQ0VBF2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem52bQ0VBF2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem52bQ0VBF2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem52bQ0VBF2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem52bQ0VBF2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem52bQ0VBF2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem52bQ0VBF2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem52bQ0VBF2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem52bQ0VBF2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem52bQ0VBF2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem52bQ0VBF2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem52bQ0VBF2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem52bQ0VBF2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem52bQ0VBF2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem52bQ0VBF2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem52bQ0VBF2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem52bQ0VBF2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem52bQ0VBF2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem52bQ0VBF2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem52bQ0VBF2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem52bQ0VBF2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem52bQ0VBF2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem52bQ0VBF2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem52bQ0VBF2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem52bQ0VBF2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem52bQ0VBF2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem52bQ0VBF2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem52bQ0VBF2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem52bQ0VBF2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem52bQ0VBF2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem52bQ0VBF2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms