Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T8

Cntnap5b, Contactin-associated protein like 5-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5bQ0V8T8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cntnap5bQ0V8T8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cntnap5bQ0V8T8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cntnap5bQ0V8T8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cntnap5bQ0V8T8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cntnap5bQ0V8T8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Cntnap5bQ0V8T8 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cntnap5bQ0V8T8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cntnap5bQ0V8T8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cntnap5bQ0V8T8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cntnap5bQ0V8T8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cntnap5bQ0V8T8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cntnap5bQ0V8T8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cntnap5bQ0V8T8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cntnap5bQ0V8T8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cntnap5bQ0V8T8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cntnap5bQ0V8T8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cntnap5bQ0V8T8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cntnap5bQ0V8T8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cntnap5bQ0V8T8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cntnap5bQ0V8T8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cntnap5bQ0V8T8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cntnap5bQ0V8T8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Cntnap5bQ0V8T8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cntnap5bQ0V8T8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cntnap5bQ0V8T8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cntnap5bQ0V8T8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cntnap5bQ0V8T8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cntnap5bQ0V8T8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cntnap5bQ0V8T8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cntnap5bQ0V8T8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cntnap5bQ0V8T8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cntnap5bQ0V8T8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Cntnap5bQ0V8T8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cntnap5bQ0V8T8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cntnap5bQ0V8T8 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cntnap5bQ0V8T8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cntnap5bQ0V8T8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cntnap5bQ0V8T8 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cntnap5bQ0V8T8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cntnap5bQ0V8T8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Cntnap5bQ0V8T8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cntnap5bQ0V8T8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cntnap5bQ0V8T8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cntnap5bQ0V8T8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cntnap5bQ0V8T8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cntnap5bQ0V8T8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cntnap5bQ0V8T8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cntnap5bQ0V8T8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cntnap5bQ0V8T8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Cntnap5bQ0V8T8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cntnap5bQ0V8T8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cntnap5bQ0V8T8 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cntnap5bQ0V8T8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cntnap5bQ0V8T8 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cntnap5bQ0V8T8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cntnap5bQ0V8T8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cntnap5bQ0V8T8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cntnap5bQ0V8T8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cntnap5bQ0V8T8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cntnap5bQ0V8T8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cntnap5bQ0V8T8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cntnap5bQ0V8T8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cntnap5bQ0V8T8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cntnap5bQ0V8T8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cntnap5bQ0V8T8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cntnap5bQ0V8T8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Cntnap5bQ0V8T8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cntnap5bQ0V8T8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Cntnap5bQ0V8T8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cntnap5bQ0V8T8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cntnap5bQ0V8T8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cntnap5bQ0V8T8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cntnap5bQ0V8T8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cntnap5bQ0V8T8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cntnap5bQ0V8T8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cntnap5bQ0V8T8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cntnap5bQ0V8T8 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cntnap5bQ0V8T8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cntnap5bQ0V8T8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cntnap5bQ0V8T8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cntnap5bQ0V8T8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cntnap5bQ0V8T8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cntnap5bQ0V8T8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cntnap5bQ0V8T8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cntnap5bQ0V8T8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cntnap5bQ0V8T8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cntnap5bQ0V8T8 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cntnap5bQ0V8T8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cntnap5bQ0V8T8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cntnap5bQ0V8T8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cntnap5bQ0V8T8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cntnap5bQ0V8T8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cntnap5bQ0V8T8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cntnap5bQ0V8T8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cntnap5bQ0V8T8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cntnap5bQ0V8T8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cntnap5bQ0V8T8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cntnap5bQ0V8T8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cntnap5bQ0V8T8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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