Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Vps8Q0P5W1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Vps8Q0P5W1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Vps8Q0P5W1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Vps8Q0P5W1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Vps8Q0P5W1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Vps8Q0P5W1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Vps8Q0P5W1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Vps8Q0P5W1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Vps8Q0P5W1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Vps8Q0P5W1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Vps8Q0P5W1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Vps8Q0P5W1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Vps8Q0P5W1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Vps8Q0P5W1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Vps8Q0P5W1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Vps8Q0P5W1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Vps8Q0P5W1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Vps8Q0P5W1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Vps8Q0P5W1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Vps8Q0P5W1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Vps8Q0P5W1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Vps8Q0P5W1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Vps8Q0P5W1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Vps8Q0P5W1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Vps8Q0P5W1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Vps8Q0P5W1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Vps8Q0P5W1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Vps8Q0P5W1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Vps8Q0P5W1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Vps8Q0P5W1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Vps8Q0P5W1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Vps8Q0P5W1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Vps8Q0P5W1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Vps8Q0P5W1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Vps8Q0P5W1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Vps8Q0P5W1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Vps8Q0P5W1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Vps8Q0P5W1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Vps8Q0P5W1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Vps8Q0P5W1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Vps8Q0P5W1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Vps8Q0P5W1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Vps8Q0P5W1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Vps8Q0P5W1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Vps8Q0P5W1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Vps8Q0P5W1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Vps8Q0P5W1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Vps8Q0P5W1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Vps8Q0P5W1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Vps8Q0P5W1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Vps8Q0P5W1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Vps8Q0P5W1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Vps8Q0P5W1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Vps8Q0P5W1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Vps8Q0P5W1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Vps8Q0P5W1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Vps8Q0P5W1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Vps8Q0P5W1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Vps8Q0P5W1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Vps8Q0P5W1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Vps8Q0P5W1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Vps8Q0P5W1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Vps8Q0P5W1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Vps8Q0P5W1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Vps8Q0P5W1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Vps8Q0P5W1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Vps8Q0P5W1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Vps8Q0P5W1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Vps8Q0P5W1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Vps8Q0P5W1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Vps8Q0P5W1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Vps8Q0P5W1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Vps8Q0P5W1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Vps8Q0P5W1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Vps8Q0P5W1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Vps8Q0P5W1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Vps8Q0P5W1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Vps8Q0P5W1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Vps8Q0P5W1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Vps8Q0P5W1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Vps8Q0P5W1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Vps8Q0P5W1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Vps8Q0P5W1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Vps8Q0P5W1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Vps8Q0P5W1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Vps8Q0P5W1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Vps8Q0P5W1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Vps8Q0P5W1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Vps8Q0P5W1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Vps8Q0P5W1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Vps8Q0P5W1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Vps8Q0P5W1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Vps8Q0P5W1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Vps8Q0P5W1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
Vps8Q0P5W1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Vps8Q0P5W1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Vps8Q0P5W1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Vps8Q0P5W1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Vps8Q0P5W1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms