Protein–RNA interactions for Protein: Q0P547

Vmn1r181, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r181Q0P547 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r181Q0P547 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r181Q0P547 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r181Q0P547 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r181Q0P547 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r181Q0P547 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r181Q0P547 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r181Q0P547 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r181Q0P547 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r181Q0P547 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r181Q0P547 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r181Q0P547 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r181Q0P547 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r181Q0P547 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r181Q0P547 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r181Q0P547 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r181Q0P547 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r181Q0P547 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r181Q0P547 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r181Q0P547 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r181Q0P547 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r181Q0P547 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r181Q0P547 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r181Q0P547 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r181Q0P547 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r181Q0P547 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r181Q0P547 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r181Q0P547 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r181Q0P547 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r181Q0P547 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r181Q0P547 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r181Q0P547 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r181Q0P547 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r181Q0P547 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r181Q0P547 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r181Q0P547 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r181Q0P547 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r181Q0P547 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r181Q0P547 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r181Q0P547 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r181Q0P547 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r181Q0P547 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r181Q0P547 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r181Q0P547 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r181Q0P547 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r181Q0P547 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r181Q0P547 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r181Q0P547 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r181Q0P547 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r181Q0P547 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r181Q0P547 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r181Q0P547 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r181Q0P547 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r181Q0P547 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r181Q0P547 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r181Q0P547 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r181Q0P547 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r181Q0P547 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r181Q0P547 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r181Q0P547 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r181Q0P547 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r181Q0P547 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r181Q0P547 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r181Q0P547 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r181Q0P547 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r181Q0P547 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r181Q0P547 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r181Q0P547 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r181Q0P547 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r181Q0P547 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r181Q0P547 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r181Q0P547 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r181Q0P547 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r181Q0P547 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r181Q0P547 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r181Q0P547 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r181Q0P547 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r181Q0P547 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r181Q0P547 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r181Q0P547 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r181Q0P547 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r181Q0P547 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r181Q0P547 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r181Q0P547 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r181Q0P547 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r181Q0P547 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r181Q0P547 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Vmn1r181Q0P547 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Vmn1r181Q0P547 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Vmn1r181Q0P547 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r181Q0P547 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r181Q0P547 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r181Q0P547 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r181Q0P547 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r181Q0P547 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r181Q0P547 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r181Q0P547 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r181Q0P547 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r181Q0P547 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r181Q0P547 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms