Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TrioQ0KL02 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TrioQ0KL02 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TrioQ0KL02 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TrioQ0KL02 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TrioQ0KL02 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TrioQ0KL02 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TrioQ0KL02 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TrioQ0KL02 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TrioQ0KL02 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TrioQ0KL02 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TrioQ0KL02 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TrioQ0KL02 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TrioQ0KL02 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TrioQ0KL02 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TrioQ0KL02 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TrioQ0KL02 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TrioQ0KL02 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TrioQ0KL02 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TrioQ0KL02 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TrioQ0KL02 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TrioQ0KL02 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TrioQ0KL02 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TrioQ0KL02 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TrioQ0KL02 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TrioQ0KL02 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TrioQ0KL02 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TrioQ0KL02 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TrioQ0KL02 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TrioQ0KL02 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TrioQ0KL02 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TrioQ0KL02 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TrioQ0KL02 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TrioQ0KL02 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TrioQ0KL02 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TrioQ0KL02 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TrioQ0KL02 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TrioQ0KL02 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TrioQ0KL02 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TrioQ0KL02 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
TrioQ0KL02 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TrioQ0KL02 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TrioQ0KL02 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TrioQ0KL02 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TrioQ0KL02 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TrioQ0KL02 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TrioQ0KL02 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TrioQ0KL02 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TrioQ0KL02 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TrioQ0KL02 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TrioQ0KL02 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TrioQ0KL02 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TrioQ0KL02 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TrioQ0KL02 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TrioQ0KL02 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TrioQ0KL02 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TrioQ0KL02 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TrioQ0KL02 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TrioQ0KL02 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TrioQ0KL02 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TrioQ0KL02 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TrioQ0KL02 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TrioQ0KL02 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TrioQ0KL02 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TrioQ0KL02 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TrioQ0KL02 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TrioQ0KL02 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TrioQ0KL02 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TrioQ0KL02 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TrioQ0KL02 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TrioQ0KL02 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TrioQ0KL02 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TrioQ0KL02 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TrioQ0KL02 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TrioQ0KL02 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TrioQ0KL02 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TrioQ0KL02 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TrioQ0KL02 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TrioQ0KL02 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TrioQ0KL02 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TrioQ0KL02 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TrioQ0KL02 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TrioQ0KL02 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TrioQ0KL02 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
TrioQ0KL02 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TrioQ0KL02 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
TrioQ0KL02 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TrioQ0KL02 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TrioQ0KL02 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TrioQ0KL02 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TrioQ0KL02 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TrioQ0KL02 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TrioQ0KL02 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TrioQ0KL02 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TrioQ0KL02 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TrioQ0KL02 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TrioQ0KL02 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TrioQ0KL02 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TrioQ0KL02 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TrioQ0KL02 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms