Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ttc21bQ0HA38 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ttc21bQ0HA38 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ttc21bQ0HA38 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Ttc21bQ0HA38 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ttc21bQ0HA38 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ttc21bQ0HA38 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ttc21bQ0HA38 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ttc21bQ0HA38 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Ttc21bQ0HA38 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ttc21bQ0HA38 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ttc21bQ0HA38 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ttc21bQ0HA38 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ttc21bQ0HA38 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ttc21bQ0HA38 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ttc21bQ0HA38 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ttc21bQ0HA38 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ttc21bQ0HA38 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ttc21bQ0HA38 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Ttc21bQ0HA38 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ttc21bQ0HA38 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ttc21bQ0HA38 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ttc21bQ0HA38 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ttc21bQ0HA38 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ttc21bQ0HA38 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ttc21bQ0HA38 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ttc21bQ0HA38 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ttc21bQ0HA38 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ttc21bQ0HA38 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ttc21bQ0HA38 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ttc21bQ0HA38 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ttc21bQ0HA38 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ttc21bQ0HA38 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ttc21bQ0HA38 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ttc21bQ0HA38 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ttc21bQ0HA38 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ttc21bQ0HA38 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ttc21bQ0HA38 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ttc21bQ0HA38 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ttc21bQ0HA38 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ttc21bQ0HA38 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ttc21bQ0HA38 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ttc21bQ0HA38 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ttc21bQ0HA38 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ttc21bQ0HA38 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ttc21bQ0HA38 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ttc21bQ0HA38 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Ttc21bQ0HA38 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ttc21bQ0HA38 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ttc21bQ0HA38 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ttc21bQ0HA38 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Ttc21bQ0HA38 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Ttc21bQ0HA38 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ttc21bQ0HA38 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ttc21bQ0HA38 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ttc21bQ0HA38 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Ttc21bQ0HA38 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ttc21bQ0HA38 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ttc21bQ0HA38 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ttc21bQ0HA38 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ttc21bQ0HA38 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ttc21bQ0HA38 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ttc21bQ0HA38 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ttc21bQ0HA38 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ttc21bQ0HA38 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ttc21bQ0HA38 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ttc21bQ0HA38 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ttc21bQ0HA38 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ttc21bQ0HA38 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ttc21bQ0HA38 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ttc21bQ0HA38 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ttc21bQ0HA38 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ttc21bQ0HA38 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ttc21bQ0HA38 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ttc21bQ0HA38 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ttc21bQ0HA38 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Ttc21bQ0HA38 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ttc21bQ0HA38 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ttc21bQ0HA38 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ttc21bQ0HA38 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ttc21bQ0HA38 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ttc21bQ0HA38 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ttc21bQ0HA38 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ttc21bQ0HA38 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ttc21bQ0HA38 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ttc21bQ0HA38 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ttc21bQ0HA38 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ttc21bQ0HA38 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ttc21bQ0HA38 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ttc21bQ0HA38 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ttc21bQ0HA38 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ttc21bQ0HA38 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ttc21bQ0HA38 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Ttc21bQ0HA38 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ttc21bQ0HA38 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ttc21bQ0HA38 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ttc21bQ0HA38 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ttc21bQ0HA38 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ttc21bQ0HA38 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ttc21bQ0HA38 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms