Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cass4Q08EC4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cass4Q08EC4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cass4Q08EC4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Cass4Q08EC4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cass4Q08EC4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cass4Q08EC4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cass4Q08EC4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cass4Q08EC4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cass4Q08EC4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cass4Q08EC4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cass4Q08EC4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cass4Q08EC4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cass4Q08EC4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cass4Q08EC4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cass4Q08EC4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cass4Q08EC4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cass4Q08EC4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cass4Q08EC4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cass4Q08EC4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cass4Q08EC4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cass4Q08EC4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cass4Q08EC4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cass4Q08EC4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cass4Q08EC4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cass4Q08EC4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cass4Q08EC4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cass4Q08EC4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cass4Q08EC4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cass4Q08EC4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cass4Q08EC4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cass4Q08EC4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cass4Q08EC4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cass4Q08EC4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cass4Q08EC4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cass4Q08EC4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cass4Q08EC4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cass4Q08EC4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cass4Q08EC4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cass4Q08EC4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Cass4Q08EC4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Cass4Q08EC4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Cass4Q08EC4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cass4Q08EC4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cass4Q08EC4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cass4Q08EC4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cass4Q08EC4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cass4Q08EC4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cass4Q08EC4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cass4Q08EC4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cass4Q08EC4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cass4Q08EC4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cass4Q08EC4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cass4Q08EC4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cass4Q08EC4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cass4Q08EC4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cass4Q08EC4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cass4Q08EC4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cass4Q08EC4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cass4Q08EC4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cass4Q08EC4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cass4Q08EC4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cass4Q08EC4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cass4Q08EC4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cass4Q08EC4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cass4Q08EC4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cass4Q08EC4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cass4Q08EC4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cass4Q08EC4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cass4Q08EC4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cass4Q08EC4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cass4Q08EC4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cass4Q08EC4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cass4Q08EC4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cass4Q08EC4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cass4Q08EC4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cass4Q08EC4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cass4Q08EC4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cass4Q08EC4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cass4Q08EC4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cass4Q08EC4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cass4Q08EC4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cass4Q08EC4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cass4Q08EC4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cass4Q08EC4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cass4Q08EC4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cass4Q08EC4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Cass4Q08EC4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cass4Q08EC4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Cass4Q08EC4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cass4Q08EC4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cass4Q08EC4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cass4Q08EC4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cass4Q08EC4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cass4Q08EC4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cass4Q08EC4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cass4Q08EC4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Cass4Q08EC4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cass4Q08EC4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cass4Q08EC4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms