Protein–RNA interactions for Protein: Q08535

Sct, Secretin, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SctQ08535 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SctQ08535 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SctQ08535 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SctQ08535 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SctQ08535 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SctQ08535 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SctQ08535 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SctQ08535 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SctQ08535 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SctQ08535 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SctQ08535 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SctQ08535 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SctQ08535 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SctQ08535 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SctQ08535 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SctQ08535 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SctQ08535 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SctQ08535 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SctQ08535 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SctQ08535 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SctQ08535 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SctQ08535 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SctQ08535 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SctQ08535 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SctQ08535 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SctQ08535 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SctQ08535 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SctQ08535 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SctQ08535 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SctQ08535 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SctQ08535 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SctQ08535 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SctQ08535 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SctQ08535 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SctQ08535 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SctQ08535 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SctQ08535 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SctQ08535 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SctQ08535 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SctQ08535 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SctQ08535 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SctQ08535 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SctQ08535 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SctQ08535 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SctQ08535 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SctQ08535 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SctQ08535 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SctQ08535 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SctQ08535 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SctQ08535 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SctQ08535 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SctQ08535 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SctQ08535 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SctQ08535 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SctQ08535 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SctQ08535 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SctQ08535 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SctQ08535 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SctQ08535 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SctQ08535 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SctQ08535 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SctQ08535 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SctQ08535 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SctQ08535 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SctQ08535 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SctQ08535 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SctQ08535 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SctQ08535 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SctQ08535 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SctQ08535 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SctQ08535 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SctQ08535 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SctQ08535 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SctQ08535 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SctQ08535 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SctQ08535 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SctQ08535 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SctQ08535 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SctQ08535 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SctQ08535 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SctQ08535 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SctQ08535 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SctQ08535 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SctQ08535 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SctQ08535 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SctQ08535 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SctQ08535 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SctQ08535 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SctQ08535 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SctQ08535 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SctQ08535 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SctQ08535 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SctQ08535 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SctQ08535 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SctQ08535 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SctQ08535 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SctQ08535 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SctQ08535 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SctQ08535 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SctQ08535 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms