Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tgm3Q08189 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tgm3Q08189 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Tgm3Q08189 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tgm3Q08189 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tgm3Q08189 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tgm3Q08189 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tgm3Q08189 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tgm3Q08189 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tgm3Q08189 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tgm3Q08189 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tgm3Q08189 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tgm3Q08189 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tgm3Q08189 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tgm3Q08189 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tgm3Q08189 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tgm3Q08189 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tgm3Q08189 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tgm3Q08189 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tgm3Q08189 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tgm3Q08189 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tgm3Q08189 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tgm3Q08189 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Tgm3Q08189 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tgm3Q08189 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tgm3Q08189 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Tgm3Q08189 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tgm3Q08189 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Tgm3Q08189 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tgm3Q08189 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tgm3Q08189 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tgm3Q08189 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tgm3Q08189 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tgm3Q08189 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tgm3Q08189 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tgm3Q08189 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tgm3Q08189 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tgm3Q08189 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Tgm3Q08189 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tgm3Q08189 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tgm3Q08189 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tgm3Q08189 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tgm3Q08189 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tgm3Q08189 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tgm3Q08189 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Tgm3Q08189 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tgm3Q08189 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tgm3Q08189 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tgm3Q08189 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tgm3Q08189 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tgm3Q08189 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tgm3Q08189 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tgm3Q08189 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tgm3Q08189 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tgm3Q08189 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tgm3Q08189 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tgm3Q08189 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Tgm3Q08189 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tgm3Q08189 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tgm3Q08189 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tgm3Q08189 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tgm3Q08189 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tgm3Q08189 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tgm3Q08189 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tgm3Q08189 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tgm3Q08189 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tgm3Q08189 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tgm3Q08189 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tgm3Q08189 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tgm3Q08189 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tgm3Q08189 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tgm3Q08189 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tgm3Q08189 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tgm3Q08189 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tgm3Q08189 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tgm3Q08189 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tgm3Q08189 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Tgm3Q08189 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tgm3Q08189 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tgm3Q08189 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tgm3Q08189 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tgm3Q08189 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tgm3Q08189 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tgm3Q08189 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tgm3Q08189 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tgm3Q08189 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Tgm3Q08189 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tgm3Q08189 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tgm3Q08189 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tgm3Q08189 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tgm3Q08189 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tgm3Q08189 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tgm3Q08189 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tgm3Q08189 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tgm3Q08189 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tgm3Q08189 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tgm3Q08189 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tgm3Q08189 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tgm3Q08189 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Tgm3Q08189 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms