Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnn1Q08091 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cnn1Q08091 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cnn1Q08091 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms