Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Col9a2Q07643 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Col9a2Q07643 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Col9a2Q07643 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Col9a2Q07643 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Col9a2Q07643 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Col9a2Q07643 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Col9a2Q07643 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Col9a2Q07643 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Col9a2Q07643 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Col9a2Q07643 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Col9a2Q07643 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Col9a2Q07643 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Col9a2Q07643 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Col9a2Q07643 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Col9a2Q07643 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Col9a2Q07643 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Col9a2Q07643 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Col9a2Q07643 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Col9a2Q07643 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Col9a2Q07643 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Col9a2Q07643 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Col9a2Q07643 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Col9a2Q07643 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Col9a2Q07643 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Col9a2Q07643 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Col9a2Q07643 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Col9a2Q07643 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Col9a2Q07643 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Col9a2Q07643 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Col9a2Q07643 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Col9a2Q07643 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Col9a2Q07643 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Col9a2Q07643 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Col9a2Q07643 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Col9a2Q07643 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Col9a2Q07643 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Col9a2Q07643 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Col9a2Q07643 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Col9a2Q07643 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Col9a2Q07643 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Col9a2Q07643 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Col9a2Q07643 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Col9a2Q07643 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Col9a2Q07643 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Col9a2Q07643 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Col9a2Q07643 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Col9a2Q07643 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Col9a2Q07643 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Col9a2Q07643 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Col9a2Q07643 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Col9a2Q07643 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Col9a2Q07643 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Col9a2Q07643 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Col9a2Q07643 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Col9a2Q07643 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Col9a2Q07643 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Col9a2Q07643 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Col9a2Q07643 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Col9a2Q07643 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Col9a2Q07643 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Col9a2Q07643 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Col9a2Q07643 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Col9a2Q07643 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Col9a2Q07643 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Col9a2Q07643 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Col9a2Q07643 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Col9a2Q07643 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Col9a2Q07643 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Col9a2Q07643 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Col9a2Q07643 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Col9a2Q07643 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Col9a2Q07643 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Col9a2Q07643 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Col9a2Q07643 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Col9a2Q07643 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Col9a2Q07643 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Col9a2Q07643 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Col9a2Q07643 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Col9a2Q07643 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Col9a2Q07643 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Col9a2Q07643 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Col9a2Q07643 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Col9a2Q07643 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Col9a2Q07643 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Col9a2Q07643 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Col9a2Q07643 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Col9a2Q07643 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Col9a2Q07643 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Col9a2Q07643 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Col9a2Q07643 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Col9a2Q07643 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Col9a2Q07643 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Col9a2Q07643 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Col9a2Q07643 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Col9a2Q07643 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Col9a2Q07643 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Col9a2Q07643 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Col9a2Q07643 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Col9a2Q07643 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms